More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0920 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  86.65 
 
 		 548 aa  958    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 546 aa  1094    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  86.65 
 
 		 548 aa  958    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1122  transporter, BCCT family protein  51.25 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  50.3 
 
 		 503 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  49.71 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  48.61 
 
 		 520 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  48.61 
 
 		 520 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  46.44 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  46.84 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  46.84 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  46.64 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  46.64 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  46.84 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  46.64 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  46.64 
 
 		 505 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  46.84 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  46.84 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  45.06 
 
 		 504 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  45.94 
 
 		 516 aa  428  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  45.57 
 
 		 523 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  44.02 
 
 		 532 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  43.27 
 
 		 659 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  44.59 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  45.44 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  43.27 
 
 		 659 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  45.44 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  45.44 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  45.44 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  45.44 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  44.64 
 
 		 506 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  45.63 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  45.24 
 
 		 516 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  39.96 
 
 		 657 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  43.75 
 
 		 490 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  44.44 
 
 		 516 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  43.34 
 
 		 573 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  39.26 
 
 		 551 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  41.37 
 
 		 531 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  42.36 
 
 		 583 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  43.23 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  39.89 
 
 		 610 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  41.57 
 
 		 494 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  45.59 
 
 		 660 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  46.85 
 
 		 525 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  38.9 
 
 		 582 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  37.39 
 
 		 581 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  44.25 
 
 		 573 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  37.77 
 
 		 581 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  41.99 
 
 		 603 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  44.62 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  42.04 
 
 		 544 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  42.02 
 
 		 582 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  42.54 
 
 		 661 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  40.73 
 
 		 580 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  45.49 
 
 		 658 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  41.72 
 
 		 531 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  42.42 
 
 		 611 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  44.86 
 
 		 661 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 574 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  41.89 
 
 		 541 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  38.57 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  41.53 
 
 		 582 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  40.75 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  41.53 
 
 		 582 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  42.17 
 
 		 585 aa  389  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  43.26 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  38.68 
 
 		 592 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  42.34 
 
 		 661 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  44.22 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  44.67 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  42.94 
 
 		 673 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  40.73 
 
 		 637 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  44.47 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  44.47 
 
 		 658 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  44.67 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  37.23 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  37.13 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2619  choline/carnitine/betaine transporter  44.26 
 
 		 658 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000908403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  44.47 
 
 		 658 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  41.76 
 
 		 642 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  40.98 
 
 		 667 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  38.91 
 
 		 656 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  40.98 
 
 		 667 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  40.84 
 
 		 606 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  40.98 
 
 		 667 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  44.51 
 
 		 533 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  36.9 
 
 		 682 aa  375  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  41.07 
 
 		 664 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  38.84 
 
 		 550 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  39.93 
 
 		 682 aa  370  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  39.37 
 
 		 660 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  39.96 
 
 		 573 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  40.8 
 
 		 667 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  37.75 
 
 		 685 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  40.59 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  38.89 
 
 		 629 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  42.51 
 
 		 658 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  40.49 
 
 		 646 aa  367  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>