More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2255 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  100 
 
 
446 aa  874  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  49.78 
 
 
464 aa  443  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  47.62 
 
 
458 aa  399  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  45.5 
 
 
452 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  45.18 
 
 
445 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  46.03 
 
 
480 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  44.95 
 
 
438 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  43.12 
 
 
443 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  42.89 
 
 
443 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  42.89 
 
 
443 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  42.66 
 
 
443 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  42.89 
 
 
443 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  42.89 
 
 
443 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  42.89 
 
 
443 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
443 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  43.58 
 
 
468 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  43.58 
 
 
468 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  43.35 
 
 
468 aa  358  1e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  43.35 
 
 
468 aa  358  1e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  43.35 
 
 
468 aa  358  1e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  44.93 
 
 
442 aa  336  4e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  43.12 
 
 
442 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  42.05 
 
 
443 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  41.36 
 
 
453 aa  319  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 
460 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  43.84 
 
 
442 aa  316  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  42.26 
 
 
457 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  39.08 
 
 
441 aa  307  2e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  41.74 
 
 
452 aa  306  4e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  41.74 
 
 
452 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  41.34 
 
 
457 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  41.74 
 
 
452 aa  305  9e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  42.08 
 
 
439 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  38.1 
 
 
445 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  41.34 
 
 
468 aa  275  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  38.32 
 
 
445 aa  275  1e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  38.32 
 
 
445 aa  275  2e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  38.32 
 
 
445 aa  275  2e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  38.32 
 
 
445 aa  275  2e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  38.32 
 
 
445 aa  275  2e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.89575e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  38.32 
 
 
445 aa  275  2e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
469 aa  275  2e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  31.02 
 
 
447 aa  212  9e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  1.4456e-12 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  31.25 
 
 
434 aa  209  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  33.78 
 
 
465 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
465 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 
423 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  32.53 
 
 
427 aa  193  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.62 
 
 
476 aa  189  6e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  29.98 
 
 
459 aa  184  2e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
451 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  31.8 
 
 
477 aa  181  3e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  29.56 
 
 
471 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
451 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  29.45 
 
 
441 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  29.45 
 
 
443 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.63 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.89 
 
 
455 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.54 
 
 
455 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
451 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 
477 aa  158  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
472 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  30.32 
 
 
463 aa  157  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  1.99551e-15 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.67 
 
 
459 aa  157  5e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.71 
 
 
474 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  29.61 
 
 
465 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  29.52 
 
 
469 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.51 
 
 
474 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
459 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  31.38 
 
 
485 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.28 
 
 
474 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.44 
 
 
457 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
435 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.51 
 
 
474 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.05 
 
 
473 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
473 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  29.3 
 
 
452 aa  153  6e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.41 
 
 
447 aa  153  6e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.04 
 
 
468 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.98546e-05  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
456 aa  152  9e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  29.83 
 
 
493 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  28.84 
 
 
471 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.96 
 
 
473 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
508 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  30.2 
 
 
463 aa  149  1e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  29.95 
 
 
458 aa  149  1e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
474 aa  148  2e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  29.03 
 
 
438 aa  148  2e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  27.1 
 
 
499 aa  148  2e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  27.31 
 
 
467 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  26.72 
 
 
454 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.66 
 
 
476 aa  147  4e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  28.38 
 
 
448 aa  146  8e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
478 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
478 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
447 aa  146  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
478 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
478 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  30.2 
 
 
475 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  30.2 
 
 
475 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>