More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0084 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0084  ABC transporter related  100 
 
 		 209 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  97.99 
 
 		 527 aa  337  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  76.38 
 
 		 527 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  61.31 
 
 		 530 aa  248  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  61.81 
 
 		 535 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  62.81 
 
 		 531 aa  245  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  58.79 
 
 		 525 aa  229  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  65.5 
 
 		 534 aa  221  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  58.38 
 
 		 545 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  58.29 
 
 		 524 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  55.28 
 
 		 532 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  56.28 
 
 		 533 aa  204  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  58.29 
 
 		 534 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  56.78 
 
 		 531 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  51.26 
 
 		 526 aa  187  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.23 
 
 		 524 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 536 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 536 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  45.59 
 
 		 554 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  44.28 
 
 		 557 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  45.81 
 
 		 549 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  44.39 
 
 		 541 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  45.37 
 
 		 535 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 544 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  44.86 
 
 		 565 aa  138  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  44.39 
 
 		 537 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 539 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  44.39 
 
 		 537 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  44.39 
 
 		 537 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  40.3 
 
 		 548 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  44.76 
 
 		 516 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  42.44 
 
 		 541 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 511 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.79 
 
 		 538 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  40.7 
 
 		 553 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  42.93 
 
 		 530 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  44.06 
 
 		 553 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  38.83 
 
 		 541 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  38.5 
 
 		 531 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  37.44 
 
 		 525 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  43.56 
 
 		 555 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  40.87 
 
 		 548 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  36.95 
 
 		 525 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  36.14 
 
 		 530 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 558 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 548 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  33.5 
 
 		 534 aa  118  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 548 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 548 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 548 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 548 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 548 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 548 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 548 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 520 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  37.93 
 
 		 535 aa  114  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  38.61 
 
 		 535 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  41.79 
 
 		 532 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  42.21 
 
 		 642 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  37.75 
 
 		 542 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  32.66 
 
 		 529 aa  111  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  40 
 
 		 552 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 545 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  35.45 
 
 		 620 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  31.34 
 
 		 528 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  42.05 
 
 		 608 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  32.04 
 
 		 529 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  38.16 
 
 		 546 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  33.5 
 
 		 519 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  37.79 
 
 		 691 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  35.35 
 
 		 529 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.42 
 
 		 548 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  34.22 
 
 		 523 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  39.2 
 
 		 641 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  37.04 
 
 		 554 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 		 615 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  32.52 
 
 		 436 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1075  predicted protein  32.02 
 
 		 518 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 		 555 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.89 
 
 		 531 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.36 
 
 		 630 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2952  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 		 541 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2013  ABC transporter-related protein  29.82 
 
 		 541 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000145808  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1063  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 671 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2288  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 		 541 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000589648  hitchhiker  1.14082e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2689  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 		 541 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000011561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2667  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 		 541 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000362923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2994  ABC transporter, ATP-binding protein  29.03 
 
 		 541 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000223296  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  37.38 
 
 		 550 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2947  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 		 541 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10459e-43 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0830  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  38.17 
 
 		 673 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  34.7 
 
 		 656 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  36.68 
 
 		 636 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 		 606 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  40.31 
 
 		 617 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  36.45 
 
 		 643 aa  99.8  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 636 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2988  ABC transporter, ATP-binding protein  29.03 
 
 		 541 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000213646  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.16 
 
 		 550 aa  99.8  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  35.53 
 
 		 627 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>