More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0757 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  72.78 
 
 		 188 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  72.93 
 
 		 188 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  71.82 
 
 		 188 aa  265  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  70.33 
 
 		 188 aa  262  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  66.85 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  58.43 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  53.11 
 
 		 183 aa  191  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  54.44 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  53.07 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  54.24 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  51.14 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  50.28 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  39.27 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  31.69 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  32.04 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  31.69 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  31.67 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  31.67 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  31.67 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  30.56 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  32.78 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  34.3 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  31.79 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  31.64 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.37 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  33.52 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  34.1 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.21 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  32.03 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.21 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.21 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  29.31 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 		 342 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  32.37 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  36.64 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  32.18 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  30.13 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  28.9 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  30.67 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  30.99 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  27.85 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  30.07 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  24.31 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  24.02 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  29.37 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>