151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0014 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  83.87 
 
 		 564 aa  986    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 		 563 aa  1152    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  52.58 
 
 		 568 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  48.02 
 
 		 574 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.36 
 
 		 570 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.7 
 
 		 593 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  37.45 
 
 		 588 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.44 
 
 		 566 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.48 
 
 		 595 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  37.1 
 
 		 561 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.72 
 
 		 593 aa  329  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  36.43 
 
 		 578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.71 
 
 		 594 aa  326  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.97 
 
 		 592 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.74 
 
 		 563 aa  320  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  36.26 
 
 		 584 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  36.4 
 
 		 568 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  36.4 
 
 		 585 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.98 
 
 		 562 aa  317  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  36.21 
 
 		 585 aa  317  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  36.98 
 
 		 562 aa  317  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  37.43 
 
 		 578 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.84 
 
 		 580 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.8 
 
 		 582 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  34.69 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.58 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  36.08 
 
 		 590 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  34.69 
 
 		 562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.51 
 
 		 562 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.58 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  35.8 
 
 		 590 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  35.65 
 
 		 584 aa  299  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.78 
 
 		 574 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  34.55 
 
 		 586 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  35.28 
 
 		 586 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  37.23 
 
 		 585 aa  281  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.47 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.1 
 
 		 581 aa  270  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  34.66 
 
 		 572 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  34.28 
 
 		 570 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  33.93 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  29.63 
 
 		 550 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.19 
 
 		 587 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  30.06 
 
 		 556 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  27.06 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  28.1 
 
 		 539 aa  187  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29 
 
 		 549 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  30.25 
 
 		 562 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  29.68 
 
 		 565 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  30.25 
 
 		 562 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  29.62 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  39.63 
 
 		 294 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.45 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.35 
 
 		 585 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  26.6 
 
 		 590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.02 
 
 		 554 aa  173  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  26.11 
 
 		 590 aa  171  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.33 
 
 		 558 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.55 
 
 		 560 aa  164  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  28.26 
 
 		 570 aa  163  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.24 
 
 		 557 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  27.35 
 
 		 569 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  27.14 
 
 		 562 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.2 
 
 		 573 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.8 
 
 		 568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.57 
 
 		 608 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  26.35 
 
 		 558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.94 
 
 		 591 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.77 
 
 		 591 aa  120  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.77 
 
 		 591 aa  118  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.06 
 
 		 592 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.69 
 
 		 513 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.67 
 
 		 610 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  29.77 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  24.01 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.02 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  26.62 
 
 		 554 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.31 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.66 
 
 		 553 aa  101  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  23.79 
 
 		 583 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  22.97 
 
 		 602 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  45.95 
 
 		 121 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  26.35 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  26.35 
 
 		 551 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.24 
 
 		 575 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  26.35 
 
 		 558 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  26.35 
 
 		 554 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  26.35 
 
 		 558 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4055  hemolysin activator protein  39.86 
 
 		 180 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  23.26 
 
 		 583 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.48 
 
 		 580 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  28.78 
 
 		 607 aa  94  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.29 
 
 		 583 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  26.54 
 
 		 520 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.47 
 
 		 585 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  28.72 
 
 		 354 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  29.51 
 
 		 553 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.77 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  24.45 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.04 
 
 		 597 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>