More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2961 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  93.24 
 
 		 296 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  91.22 
 
 		 296 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  86.82 
 
 		 319 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  80.41 
 
 		 296 aa  501  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  81.76 
 
 		 296 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  66.89 
 
 		 299 aa  434  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  75 
 
 		 296 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  71.48 
 
 		 300 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  71.72 
 
 		 296 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  70.79 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  71.72 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  71.38 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  66.1 
 
 		 298 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  68.81 
 
 		 297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  69.42 
 
 		 299 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  63.45 
 
 		 291 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  62.33 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  63.01 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  61.99 
 
 		 293 aa  371  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  62.03 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  62.98 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  61.59 
 
 		 290 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  61.64 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  61.59 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  58.42 
 
 		 294 aa  361  6e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  61.77 
 
 		 294 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  60.07 
 
 		 294 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 		 293 aa  359  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  61.72 
 
 		 292 aa  354  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  56.06 
 
 		 297 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  61.38 
 
 		 291 aa  343  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  61.25 
 
 		 299 aa  335  7e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  53.24 
 
 		 326 aa  321  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  55.82 
 
 		 293 aa  319  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  52.3 
 
 		 290 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 292 aa  299  5e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  50.92 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 301 aa  275  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  50.73 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  47 
 
 		 290 aa  268  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 290 aa  268  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 301 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  47 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  47 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  47.35 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  46.62 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 297 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 301 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 295 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 		 292 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 295 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 		 292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 294 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  45.7 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  44.91 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 294 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 320 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  45.94 
 
 		 290 aa  255  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 296 aa  254  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>