94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3447 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  53.61 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  56.04 
 
 		 109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  52.04 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  49.47 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  49.47 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  50.52 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  50.52 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  46.94 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  45.36 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  45.26 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  51.09 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  41.84 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  48.39 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  43.48 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  40.43 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  40.43 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  42 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  58.21 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  48.61 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  43.48 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  44.83 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  37.11 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  38.3 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  36.26 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  38.36 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  41.46 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  50.85 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  35.14 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  38.14 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  28.26 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  56.76 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  31.58 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  39.73 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  37.88 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  34.07 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  34.07 
 
 		 131 aa  48.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  30.11 
 
 		 97 aa  48.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  29.35 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  31.34 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  32.56 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  31.34 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  36.49 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  28.26 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1114  nucleotidyltransferases-like  42.86 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  34.25 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  45.31 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  32.65 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  32.61 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  31.34 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  39.39 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  37.5 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  42.62 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  33.85 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  29.89 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  27.4 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  35.48 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  34.72 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  31.51 
 
 		 96 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  31.03 
 
 		 121 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  30.67 
 
 		 97 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  34.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  38.27 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  33.82 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  33.85 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  38.98 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  42.62 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  36.21 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  29.03 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 109 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  35.38 
 
 		 97 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  40.68 
 
 		 109 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>