212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0074 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  100 
 
 		 277 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  70.07 
 
 		 275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  52.52 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  52.69 
 
 		 293 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  50.9 
 
 		 295 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  44.2 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  44.2 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  44.2 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  44.2 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  44.2 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  44.2 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  43.84 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  43.01 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  42.75 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  42.75 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  41.67 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  42.65 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  42.65 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  42.65 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  39.5 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  40.73 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  38.81 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  40.73 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  36.46 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  36.46 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  36.36 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  36.04 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  38.3 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  37.18 
 
 		 238 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  36.75 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  35.09 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  33.92 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  38.08 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  34.52 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  32.62 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  33.58 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  34.3 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  30.32 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  34.75 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.3 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  33.21 
 
 		 244 aa  85.9  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  26.6 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  38.62 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  34.17 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.36 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  33.78 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  31.68 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  29.37 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  29.2 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  27.5 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  30.67 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  27.37 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  28.41 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  30.32 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  29.95 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  31.82 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  34.84 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.9 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.52 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.97 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  27.97 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  28.16 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  31.32 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  32.53 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.93 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  35.03 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  29.54 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  27.57 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  25.55 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  27.5 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  36.64 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  23.64 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  30.12 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  26.85 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  25.18 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  26.79 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2660  pantothenate kinase  31.09 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0784  Baf family transcriptional activator  35.08 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  21.38 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  30.28 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  33.03 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  30.28 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  21.69 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  30.25 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  25.54 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  30.69 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  25.27 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.28 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  30.28 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  23.27 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  31.17 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  32.45 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  26.16 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  23.27 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  27.51 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  23.28 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  28.92 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>