232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1695 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 361 aa  721    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  33.05 
 
 		 360 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  30.92 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  28.21 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  32.31 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  29.97 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  31.27 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  29.21 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  31.48 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  30.11 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.61 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  29.01 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  28.69 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  27.86 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 367 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  27.75 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  27.12 
 
 		 792 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  25.93 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  27.25 
 
 		 391 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.84 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.53 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  27.44 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.59 
 
 		 365 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  27.52 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  25 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.93 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.74 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  22.89 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 393 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 393 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  23.89 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  22.29 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  23.84 
 
 		 370 aa  92.8  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  25.25 
 
 		 434 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.49 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  28.75 
 
 		 384 aa  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  28.12 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  23.64 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.29 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.47 
 
 		 1040 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  20.94 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  20.79 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  29.13 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  21.89 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  21.39 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  21.23 
 
 		 1096 aa  80.1  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  23.15 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.96 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  21.02 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  26.95 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.88 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  20.6 
 
 		 1061 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  20.6 
 
 		 1061 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 		 1153 aa  73.6  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  30.81 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  30.81 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  25.5 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  23.16 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  20.56 
 
 		 1111 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  22.71 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  30.3 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  23.2 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  23.87 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  22.97 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  30.23 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  22.65 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  20.11 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  29.55 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  30.58 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  23.1 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.08 
 
 		 418 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>