More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3766 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  78.03 
 
 		 246 aa  338  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 218 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  39.45 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  38.99 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1449  transcriptional regulator, GntR family  40.41 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  41.49 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  38.38 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  38.62 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  39.13 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  44.6 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4700  GntR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.445509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  37.57 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 261 aa  101  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 266 aa  99  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  36.1 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  45.11 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  32.87 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>