63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0534 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  100 
 
 		 607 aa  1211    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  63.82 
 
 		 595 aa  720    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  30.56 
 
 		 594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  31.69 
 
 		 594 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  31.56 
 
 		 589 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  29.68 
 
 		 590 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  29.36 
 
 		 592 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  29.19 
 
 		 592 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  29.19 
 
 		 592 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  30.87 
 
 		 569 aa  185  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  29.82 
 
 		 595 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  30.78 
 
 		 595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  30.78 
 
 		 595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  30.78 
 
 		 595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  30.78 
 
 		 595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  30.78 
 
 		 595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  30.78 
 
 		 595 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  30.31 
 
 		 596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  30.09 
 
 		 661 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  31.06 
 
 		 593 aa  177  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  29.36 
 
 		 592 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  31.91 
 
 		 578 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  32.52 
 
 		 592 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  32.52 
 
 		 592 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  30.31 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 565 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 560 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  33.01 
 
 		 503 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 594 aa  85.1  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  26.24 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  28.51 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  30.83 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  27.29 
 
 		 582 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.46 
 
 		 773 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  27.34 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  25.67 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  25.74 
 
 		 517 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  26.06 
 
 		 517 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  27.52 
 
 		 496 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  25.97 
 
 		 686 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  25.97 
 
 		 686 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  26.33 
 
 		 754 aa  51.6  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  21.48 
 
 		 579 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  27.63 
 
 		 612 aa  50.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  28.64 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  36.05 
 
 		 459 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  19.7 
 
 		 1090 aa  47.4  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  23.84 
 
 		 561 aa  47.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  28.1 
 
 		 489 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  31.43 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  29.66 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0609  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  25.18 
 
 		 428 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0168  O-antigen polymerase  24.19 
 
 		 400 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 516 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  26.39 
 
 		 588 aa  45.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  23.76 
 
 		 594 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  28.28 
 
 		 438 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  29.44 
 
 		 452 aa  44.3  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  30.19 
 
 		 502 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  25.11 
 
 		 433 aa  43.9  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  20.11 
 
 		 404 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>