102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2370 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1488  flagellin  81.41 
 
 		 735 aa  1104    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  62.17 
 
 		 746 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  59.26 
 
 		 753 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  60.1 
 
 		 762 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  100 
 
 		 737 aa  1395    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  61.43 
 
 		 888 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  59.93 
 
 		 888 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  60.89 
 
 		 892 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  58.26 
 
 		 886 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  60.22 
 
 		 886 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  65.73 
 
 		 523 aa  363  8e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  52.75 
 
 		 523 aa  342  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  68.89 
 
 		 528 aa  333  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  50.12 
 
 		 536 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  51.91 
 
 		 537 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  69.74 
 
 		 514 aa  313  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  69 
 
 		 522 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  69.37 
 
 		 516 aa  308  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  46.15 
 
 		 1562 aa  206  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  54.34 
 
 		 693 aa  201  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  52.97 
 
 		 692 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  45.9 
 
 		 630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  58.43 
 
 		 620 aa  184  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  51.69 
 
 		 405 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  51.69 
 
 		 405 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  50.85 
 
 		 405 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  51.27 
 
 		 405 aa  180  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  49.58 
 
 		 405 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  53.72 
 
 		 420 aa  171  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  53.18 
 
 		 572 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  53.18 
 
 		 578 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  55.62 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  52.51 
 
 		 399 aa  161  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  51.4 
 
 		 399 aa  160  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  53.07 
 
 		 399 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  51.96 
 
 		 397 aa  159  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  45.59 
 
 		 400 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  41.7 
 
 		 432 aa  151  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  47.93 
 
 		 393 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  43.3 
 
 		 300 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  41.92 
 
 		 272 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  43.71 
 
 		 272 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  43.11 
 
 		 272 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  40.72 
 
 		 272 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  41.32 
 
 		 272 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  40.72 
 
 		 272 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  41.42 
 
 		 275 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  40.72 
 
 		 275 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  34.95 
 
 		 289 aa  94.7  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  44.21 
 
 		 547 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  32.95 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  32.73 
 
 		 273 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  36.56 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.47 
 
 		 273 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  30.96 
 
 		 301 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  34.41 
 
 		 395 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  27.59 
 
 		 302 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  32.73 
 
 		 272 aa  55.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  35.48 
 
 		 320 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  28.88 
 
 		 302 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  26.11 
 
 		 321 aa  55.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  35.48 
 
 		 320 aa  55.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  36.67 
 
 		 395 aa  55.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  29.44 
 
 		 302 aa  54.7  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  34.09 
 
 		 320 aa  54.7  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  35.56 
 
 		 395 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  41.67 
 
 		 389 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  28.73 
 
 		 282 aa  52.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  29.44 
 
 		 293 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  29.79 
 
 		 289 aa  53.5  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  28.93 
 
 		 301 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  27.22 
 
 		 277 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  40.28 
 
 		 311 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  28.24 
 
 		 292 aa  51.2  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  27.92 
 
 		 302 aa  51.6  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  27.22 
 
 		 274 aa  51.2  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  27.38 
 
 		 275 aa  51.2  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  25.11 
 
 		 274 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  27.62 
 
 		 282 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  32.95 
 
 		 320 aa  49.3  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  28.65 
 
 		 281 aa  48.9  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  26.77 
 
 		 303 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  35.62 
 
 		 282 aa  47.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  32.97 
 
 		 380 aa  47.4  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  31.82 
 
 		 585 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  34.48 
 
 		 279 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 		 305 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  35.16 
 
 		 592 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  33.33 
 
 		 303 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  29.03 
 
 		 321 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  28.72 
 
 		 590 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  36.99 
 
 		 461 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  34.09 
 
 		 292 aa  45.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  36.99 
 
 		 461 aa  44.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0622  flagellin domain-containing protein  31.48 
 
 		 266 aa  44.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0151  flagellin domain-containing protein  28.22 
 
 		 516 aa  44.3  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.382062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  29.79 
 
 		 494 aa  44.3  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  28.07 
 
 		 277 aa  44.3  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 327 aa  44.3  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>