More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1304 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1304  CheW-like protein  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00117926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1494  CheW domain protein  94.92 
 
 		 178 aa  343  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  64.2 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  58.6 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  58.18 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  54.39 
 
 		 168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  55.35 
 
 		 171 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  54.39 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  54.39 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  55.7 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  54 
 
 		 157 aa  154  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  46 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0502  cheW domain-containing protein  47.4 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3978  CheW protein  45.03 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  45.45 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  45.45 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  45.45 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  45.45 
 
 		 180 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2686  CheW domain-containing protein  45.45 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  45.45 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1596  cheW domain-containing protein  45.45 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2307  CheW protein  40.13 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  41.33 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  40 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1464  CheW protein  39.86 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1438  CheW protein  39.86 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  38.85 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  38.85 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  39.33 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3736  CheW protein  38.22 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2069  CheW protein  38.13 
 
 		 144 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0828  CheW domain-containing protein  36 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.196204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32.71 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  28.97 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  33.33 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  28.57 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  32 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  25.52 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30.39 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  26.24 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  26.24 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  22.55 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  23.46 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.67 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  26.76 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  24.64 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  25.85 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  25.71 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.08 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  26.42 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  21.83 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  22.55 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  26.57 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0654  putative CheW protein  31.46 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  21.57 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  25.71 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  24.31 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  25.77 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  22.6 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  23.58 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  24.31 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  24.31 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  31 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00413  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 102 aa  52  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497597  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  31 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  28.18 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  27.03 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  20.75 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  25.35 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  25.83 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.98 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26.24 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  41.51 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  28.57 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  28.85 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  23.61 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.14 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.42 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  23.42 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.7 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  41.51 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0056  CheW protein  31.33 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  23.42 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  23.42 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  23.61 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  25.74 
 
 		 518 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  26.76 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  25.71 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  37.84 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  27.27 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  24.54 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  37.84 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  28.57 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  22.73 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  37.84 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  24.54 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  24.54 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  24.54 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  41.51 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>