209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2094 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  86.9 
 
 		 397 aa  719    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  100 
 
 		 397 aa  804    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  86.65 
 
 		 397 aa  718    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  89.42 
 
 		 397 aa  734    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  68.39 
 
 		 399 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  68.37 
 
 		 403 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  67.09 
 
 		 403 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  64.66 
 
 		 411 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  67.53 
 
 		 398 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  66.31 
 
 		 407 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2394  PepSY-associated TM helix  40.42 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.31 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 389 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  37.33 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.07 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.8 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  35.62 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  26 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  30.27 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  26.73 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  25.95 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0817  PepSY-associated TM helix domain protein  27.04 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.74 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  26.82 
 
 		 383 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  25.06 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  26.03 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  25 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  25.26 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.97 
 
 		 376 aa  90.9  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.54 
 
 		 386 aa  89.7  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  26.04 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3008  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.44 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  24.03 
 
 		 377 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  24.87 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  26.28 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  26.75 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2069  PepSY-associated TM helix domain protein  24.39 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  24.65 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1435  PepSY-associated membrane protein  29.03 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.37 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.2 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.32 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.14 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3271  PepSY-associated TM helix  27.75 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  24.81 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  23.92 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  22.2 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  25.91 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.68 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3894  PepSY-associated TM helix domain protein  27.39 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.29 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1737  hypothetical protein  25.27 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.13 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.53 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  25.07 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  28.11 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.32 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  26.18 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.39 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  25 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  25 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  25.13 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  23.86 
 
 		 641 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.98 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  21.37 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  23.34 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.75 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  24.57 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  25.25 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  24.59 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  24.76 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2723  putative iron-regulated membrane protein  26.61 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  24.73 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  25.44 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  21.9 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  24.7 
 
 		 527 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  24.54 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.11 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.44 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  23.87 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1877  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.89 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  24.82 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  24.42 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.51 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  25.3 
 
 		 539 aa  63.2  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  28.43 
 
 		 451 aa  62.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.13 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.66 
 
 		 851 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  23.63 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.98 
 
 		 849 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  22.88 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  23.34 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  23.62 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  23.57 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.99 
 
 		 570 aa  60.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>