More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2558 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  66.39 
 
 		 767 aa  1006    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 760 aa  1559    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  67.62 
 
 		 737 aa  1022    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1569  TonB-dependent receptor  55.81 
 
 		 767 aa  846    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.428413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  46.7 
 
 		 739 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  33.51 
 
 		 722 aa  364  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 720 aa  352  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 745 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 732 aa  288  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 732 aa  286  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 751 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 742 aa  277  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 742 aa  277  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 770 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 753 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 710 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 710 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  29.82 
 
 		 743 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 734 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 719 aa  261  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 707 aa  260  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 736 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 792 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 747 aa  254  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 757 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 709 aa  250  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 715 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 694 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 751 aa  243  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 821 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 780 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  29.22 
 
 		 753 aa  234  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 760 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 733 aa  231  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 763 aa  230  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 768 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 733 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 741 aa  227  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 753 aa  226  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 759 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 732 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  28.22 
 
 		 772 aa  224  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 748 aa  224  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 748 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  28.14 
 
 		 748 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 727 aa  223  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 759 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 724 aa  220  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 773 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 766 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 747 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 769 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 747 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 815 aa  213  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 755 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 731 aa  211  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  27.2 
 
 		 765 aa  210  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 740 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 747 aa  208  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 741 aa  207  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 747 aa  207  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 747 aa  207  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 748 aa  206  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 733 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 777 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 762 aa  205  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 747 aa  204  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 733 aa  204  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 706 aa  203  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 706 aa  203  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  27.96 
 
 		 695 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 689 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  26.51 
 
 		 754 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 731 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 731 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 733 aa  202  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 731 aa  201  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 689 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 698 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  24.7 
 
 		 779 aa  198  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 805 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  24.87 
 
 		 763 aa  196  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 730 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  26.07 
 
 		 730 aa  194  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 748 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 826 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 730 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 730 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 730 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 700 aa  187  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 776 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 764 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  24.9 
 
 		 760 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 760 aa  181  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  24.9 
 
 		 760 aa  181  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  24.9 
 
 		 760 aa  181  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  26.93 
 
 		 843 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  24.9 
 
 		 760 aa  181  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>