More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1141 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  100 
 
 		 150 aa  287  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  75.17 
 
 		 150 aa  209  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  70 
 
 		 150 aa  209  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  36.18 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  39.31 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  38.62 
 
 		 153 aa  94.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  46.73 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  36.22 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  37.84 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  41.86 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  41.32 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.77 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  38.1 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  38.36 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  37.67 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.06 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  34.17 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  34.25 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.07 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  40.16 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  37.67 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  38.79 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.56 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 150 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  38.19 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.74 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.19 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  33.57 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  32.56 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  38.28 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  33.88 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  40.19 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  35.54 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  38.89 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  36.43 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  34.23 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  37.17 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  32.39 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  30.47 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1274 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  32.46 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  30.94 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.15 
 
 		 633 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  36.22 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  33.09 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  35.4 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  34.06 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.4 
 
 		 478 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  39.77 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  36.75 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.86 
 
 		 488 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  37.93 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  36.94 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  33.87 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  31.11 
 
 		 186 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  36.61 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  33.6 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  30.65 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  29.84 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  31.75 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  31.9 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  30.88 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  29.51 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 489 aa  61.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  31.03 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  31.78 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  35.29 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  29.92 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  29.46 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  34 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  33.33 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  28.68 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  31.48 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  31.97 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  37.93 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>