More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3517 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 305 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  68.54 
 
 		 302 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  67.45 
 
 		 303 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  67.88 
 
 		 302 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  67.45 
 
 		 303 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  67.55 
 
 		 302 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  68.54 
 
 		 302 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  66.89 
 
 		 304 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  68.11 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  68.44 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  65.46 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  52.27 
 
 		 313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  51.31 
 
 		 304 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  48.52 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  50.49 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  51.75 
 
 		 317 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  50.5 
 
 		 302 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  49.84 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  48.16 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  49.15 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  48.38 
 
 		 315 aa  272  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  47.4 
 
 		 309 aa  271  7e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  44.85 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  46.23 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  45.36 
 
 		 315 aa  267  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  46.77 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  46.53 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  45.42 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  46.64 
 
 		 315 aa  262  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  45.45 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  43.52 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  46.43 
 
 		 315 aa  259  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  45.6 
 
 		 314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  44.85 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  46.56 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  45.13 
 
 		 315 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  45.13 
 
 		 315 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  45.13 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  45.9 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  45.9 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  49.32 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  47.46 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  45.57 
 
 		 315 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  42.33 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  44.92 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  44.41 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  43.75 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  45.45 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  42.23 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  43.42 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  44.26 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  44.26 
 
 		 316 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  44.26 
 
 		 316 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  44.26 
 
 		 316 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  43.96 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  44.07 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  44.74 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  45.08 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  43.51 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  43.51 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  43.28 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  41.11 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  43.38 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  42.81 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  43.51 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  42.86 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  43.18 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  43.93 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  40.8 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  40.8 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  40.8 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  40.8 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  40.8 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  40.8 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  40.8 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  40.8 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  40.8 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  43 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  43.93 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  43.59 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  44 
 
 		 322 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  41.33 
 
 		 323 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  41.33 
 
 		 323 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  43.93 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  41.33 
 
 		 323 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  41.33 
 
 		 323 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  41.33 
 
 		 323 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  41.39 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  42.53 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  42.86 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  44.26 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  42.95 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  42.63 
 
 		 324 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  43.27 
 
 		 323 aa  245  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  43.38 
 
 		 322 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  43.38 
 
 		 322 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  43.38 
 
 		 322 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  42.95 
 
 		 323 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  44.22 
 
 		 316 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3865  preprotein translocase subunit SecF  43.73 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>