247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0723 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  895    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  60.13 
 
 
441 aa  519  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  54.98 
 
 
442 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  55.76 
 
 
443 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  49.77 
 
 
403 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  47.76 
 
 
441 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  47.79 
 
 
444 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  33.26 
 
 
481 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  29.05 
 
 
478 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  27.02 
 
 
480 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  28.48 
 
 
483 aa  179  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  26.82 
 
 
498 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  27.51 
 
 
417 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  27.12 
 
 
501 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 
527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 
495 aa  146  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  25.05 
 
 
651 aa  146  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  26.67 
 
 
456 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  26.35 
 
 
486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 
391 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.83 
 
 
391 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 
792 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.02 
 
 
388 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.67 
 
 
418 aa  93.6  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  26.96 
 
 
399 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  28.02 
 
 
389 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.84 
 
 
418 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 
391 aa  86.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 
1153 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 
365 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 
1061 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.27 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.1 
 
 
394 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.65 
 
 
1061 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  24.41 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.54 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 
1096 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  25.16 
 
 
392 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 
1040 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  32.58 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  29.1 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  26.03 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 
392 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  24.28 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  27.83 
 
 
384 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  20.87 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  27.21 
 
 
395 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  21.99 
 
 
364 aa  63.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  20.18 
 
 
359 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.34 
 
 
434 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 
363 aa  63.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 
391 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 
370 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  23.53 
 
 
399 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  23.79 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  23.62 
 
 
402 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  23.79 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  24.13 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  25.11 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 
393 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 
393 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 
371 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 
383 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  23.08 
 
 
390 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 
393 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 
393 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  26.43 
 
 
358 aa  60.1  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  19.37 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  23.78 
 
 
402 aa  59.7  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  22.27 
 
 
389 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 
371 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  19.74 
 
 
1111 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  22.3 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  21.83 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  23.81 
 
 
372 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  30.43 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 
388 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.77 
 
 
423 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  30.43 
 
 
357 aa  57  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 
372 aa  57  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 
388 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  23.32 
 
 
396 aa  56.6  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  23.95 
 
 
388 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  21 
 
 
384 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5426  hypothetical protein  28.25 
 
 
230 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  22.97 
 
 
389 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  28.03 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>