More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1401 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  84.34 
 
 		 501 aa  814    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  78.69 
 
 		 504 aa  768    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  80.08 
 
 		 514 aa  779    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 507 aa  999    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.81 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.69 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0354907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.94 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  43.42 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  40.36 
 
 		 481 aa  310  4e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.69 
 
 		 462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.32 
 
 		 482 aa  297  4e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.12 
 
 		 478 aa  296  5e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.97 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.26 
 
 		 519 aa  277  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.41 
 
 		 477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.28 
 
 		 493 aa  263  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  37.28 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 		 515 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  39.47 
 
 		 479 aa  256  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.82 
 
 		 530 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.06 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.28 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.44 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.95 
 
 		 509 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.11 
 
 		 480 aa  242  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.8 
 
 		 510 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.9 
 
 		 504 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.86 
 
 		 504 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.21 
 
 		 521 aa  237  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.9 
 
 		 498 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  38.13 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.27 
 
 		 503 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.72 
 
 		 530 aa  233  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.91 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.88 
 
 		 513 aa  229  9e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.62 
 
 		 524 aa  229  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.45 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.65 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.88 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.56 
 
 		 511 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.92 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.95 
 
 		 525 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.82 
 
 		 517 aa  225  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.37 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.4 
 
 		 516 aa  223  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.08 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.82 
 
 		 533 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.29 
 
 		 505 aa  220  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.49 
 
 		 514 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.54 
 
 		 502 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.19 
 
 		 504 aa  217  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.91 
 
 		 524 aa  217  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  28.74 
 
 		 499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.65 
 
 		 512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  33.71 
 
 		 524 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.07 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.89 
 
 		 512 aa  209  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.88 
 
 		 524 aa  210  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.49 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.53 
 
 		 520 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  33.72 
 
 		 519 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.28 
 
 		 521 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.79 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.82 
 
 		 499 aa  203  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.06 
 
 		 513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.47 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.97 
 
 		 530 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  32.86 
 
 		 496 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  33.26 
 
 		 496 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.91 
 
 		 499 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.96 
 
 		 523 aa  196  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.55 
 
 		 506 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.56 
 
 		 499 aa  192  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.52 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.39 
 
 		 527 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0691  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.24 
 
 		 287 aa  189  9e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  36.42 
 
 		 507 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.58 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  36.77 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.72 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  33.88 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  34.17 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 494 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.83 
 
 		 516 aa  186  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  35.09 
 
 		 490 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  35.48 
 
 		 436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.06 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  32.99 
 
 		 514 aa  183  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.37 
 
 		 488 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.19 
 
 		 494 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.19 
 
 		 494 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.36 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 515 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  35.02 
 
 		 508 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34 
 
 		 499 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.12 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  32.77 
 
 		 496 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.7 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  32.81 
 
 		 510 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>