72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1777 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1777  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857192  decreased coverage  0.00810596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1978  hypothetical protein  66.67 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1907  hypothetical protein  50.78 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0763  hypothetical protein  41.36 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.189184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2650  hypothetical protein  44.15 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.811188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0518  hypothetical protein  45.16 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 977 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 936 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  36.9 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  33.33 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 358 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 952 aa  51.2  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  30 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  33.67 
 
 		 869 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  36.9 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  36.47 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 580 aa  49.3  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  32.54 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 495 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 347 aa  48.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  33.68 
 
 		 852 aa  48.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  33.72 
 
 		 931 aa  47.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  33.72 
 
 		 910 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  30.34 
 
 		 473 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  32.56 
 
 		 920 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 947 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  36.14 
 
 		 948 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  31.76 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  30.12 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  31.73 
 
 		 834 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  32.53 
 
 		 478 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 919 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 833 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  32.56 
 
 		 915 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 478 aa  45.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2021  polysaccharide export protein  27.2 
 
 		 341 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  31.4 
 
 		 921 aa  45.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  31.03 
 
 		 700 aa  44.7  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  26.27 
 
 		 492 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  29.75 
 
 		 551 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  33.73 
 
 		 781 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  31.03 
 
 		 700 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 849 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  30.21 
 
 		 388 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  30 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 919 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 495 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 495 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  30.21 
 
 		 379 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 912 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  30.59 
 
 		 828 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 352 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 803 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 828 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  32.18 
 
 		 392 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 397 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.07 
 
 		 827 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  28.4 
 
 		 779 aa  41.6  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  31.76 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 392 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 392 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.91 
 
 		 429 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  32.58 
 
 		 508 aa  41.2  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 922 aa  41.2  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>