49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0763 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0763  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.189184  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2650  hypothetical protein  52.88 
 
 
204 aa  207  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.811188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0518  hypothetical protein  50.28 
 
 
181 aa  179  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1907  hypothetical protein  41.15 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1777  hypothetical protein  41.36 
 
 
190 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857192  decreased coverage  0.00810596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1978  hypothetical protein  50.75 
 
 
260 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0586207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  40.22 
 
 
700 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  29.91 
 
 
580 aa  55.1  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  35.78 
 
 
700 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  34.94 
 
 
379 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.63 
 
 
703 aa  52.4  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  32 
 
 
473 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  35.63 
 
 
551 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  36.14 
 
 
362 aa  49.3  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  30.12 
 
 
213 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  26.92 
 
 
977 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  32.53 
 
 
478 aa  48.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  28.7 
 
 
295 aa  48.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  35.16 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  31.76 
 
 
781 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  31.4 
 
 
869 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  33.04 
 
 
247 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  31.33 
 
 
388 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  31.46 
 
 
852 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  27.59 
 
 
358 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  27.91 
 
 
936 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  32 
 
 
495 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  32 
 
 
495 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  33.73 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  33.73 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  33.73 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  29.41 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  27.91 
 
 
952 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  28.95 
 
 
360 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  32.53 
 
 
387 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  33.33 
 
 
268 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  27.91 
 
 
833 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  21.98 
 
 
216 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  25.3 
 
 
209 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  33.72 
 
 
324 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  28 
 
 
834 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  25.96 
 
 
492 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1589  DNA uptake protein related DNA-binding protein  36.67 
 
 
211 aa  41.2  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.821877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  32.91 
 
 
244 aa  41.2  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  29.41 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  38.24 
 
 
192 aa  41.2  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  33.33 
 
 
268 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  30.38 
 
 
229 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  25.69 
 
 
478 aa  41.2  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>