23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0518 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0518  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2650  hypothetical protein  61.83 
 
 		 204 aa  234  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.811188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0763  hypothetical protein  50.28 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.189184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1907  hypothetical protein  51.95 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1777  hypothetical protein  45.16 
 
 		 190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857192  decreased coverage  0.00810596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1978  hypothetical protein  51.82 
 
 		 260 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 580 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  31.76 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  25.51 
 
 		 295 aa  45.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  32.22 
 
 		 473 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 387 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  30.68 
 
 		 388 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 358 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 936 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 478 aa  42.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25 
 
 		 700 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 188 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  26.52 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  28.97 
 
 		 753 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  28.18 
 
 		 977 aa  41.2  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  34.48 
 
 		 268 aa  41.2  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 824 aa  40.8  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>