37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1978 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586207 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1777  hypothetical protein  68.91 
 
 		 190 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857192  decreased coverage  0.00810596 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1907  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0763  hypothetical protein  47.33 
 
 		 191 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.189184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2650  hypothetical protein  40.21 
 
 		 204 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.811188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0518  hypothetical protein  44.94 
 
 		 181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  32.35 
 
 		 977 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  32.94 
 
 		 947 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 580 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  30.95 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 869 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 936 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 952 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 473 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 352 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  32.94 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  34.12 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 833 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32.53 
 
 		 781 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 495 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  27.87 
 
 		 478 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  27.83 
 
 		 849 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  34.52 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  26.19 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  25.74 
 
 		 358 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  34.12 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  31.91 
 
 		 827 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 495 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 495 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  29.07 
 
 		 700 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>