More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4476 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  100 
 
 		 122 aa  249  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  92.62 
 
 		 145 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  82.11 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  73.55 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  72.73 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  72.73 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  71.31 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  65.45 
 
 		 125 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  71.28 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  74.44 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  58.41 
 
 		 114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  65.26 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  50 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  50 
 
 		 360 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  50 
 
 		 360 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  59.38 
 
 		 123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  59.78 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  64.13 
 
 		 358 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  60.82 
 
 		 285 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 150 aa  120  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  60.64 
 
 		 199 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  45.3 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  45.3 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  54.72 
 
 		 339 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 324 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  55.67 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  45.3 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  45.3 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  46.09 
 
 		 131 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 323 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 266 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 275 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 275 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  55.17 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  53.54 
 
 		 211 aa  114  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  52.07 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  45.8 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  46.9 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  47.62 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  54.08 
 
 		 342 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  53.26 
 
 		 239 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 262 aa  113  7.999999999999999e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  45.79 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 371 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 238 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  51.52 
 
 		 230 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 203 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  50 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  51.52 
 
 		 230 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  51.52 
 
 		 242 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  51.52 
 
 		 242 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 367 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 293 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  51.52 
 
 		 211 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  51.52 
 
 		 211 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  51.52 
 
 		 211 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  50.91 
 
 		 290 aa  110  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 203 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 255 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 259 aa  110  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  47.66 
 
 		 265 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  49.09 
 
 		 259 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  56.52 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 202 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 370 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  52.78 
 
 		 367 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  50.93 
 
 		 297 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 322 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 265 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 214 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  49.55 
 
 		 342 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 282 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 249 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 249 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 257 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  49.11 
 
 		 214 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  52 
 
 		 341 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  50 
 
 		 246 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  43.75 
 
 		 249 aa  107  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  46.85 
 
 		 342 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  46.53 
 
 		 263 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>