More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0535 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0535  short chain dehydrogenase  100 
 
 
244 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  90.57 
 
 
244 aa  460  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  90.16 
 
 
244 aa  457  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05991  short chain dehydrogenase  78.88 
 
 
254 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0731  short chain dehydrogenase  55.17 
 
 
235 aa  288  7e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05381  short chain dehydrogenase  57.14 
 
 
235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1632  short chain dehydrogenase  53.88 
 
 
235 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05911  short chain dehydrogenase  56.3 
 
 
240 aa  278  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1866  short chain dehydrogenase  55.88 
 
 
240 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0671437  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07831  short chain dehydrogenase  54.2 
 
 
241 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.956383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 
242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 
242 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
241 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
240 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3351  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 
242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
241 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  40.77 
 
 
245 aa  178  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0295505  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
250 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
250 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
257 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
248 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
260 aa  118  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
256 aa  118  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  30.13 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.77 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00806787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  29.71 
 
 
239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
235 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.41 
 
 
239 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
249 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
249 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
253 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.82 
 
 
241 aa  112  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.03 
 
 
248 aa  111  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.93 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  29.61 
 
 
588 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 
271 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  29.61 
 
 
588 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62919  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  29.61 
 
 
588 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
261 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
282 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.92 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.53 
 
 
245 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.71 
 
 
238 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832513  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.76 
 
 
238 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
246 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
250 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 
239 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  28.39 
 
 
1270 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 
258 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
312 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
243 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
246 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 
245 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0693  sepiapterin reductase  29.83 
 
 
241 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.91 
 
 
238 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 
263 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 
263 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
239 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 
263 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.43 
 
 
266 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  35.26 
 
 
263 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
242 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 
263 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.93 
 
 
330 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.13 
 
 
241 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 
263 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
255 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 
263 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 
263 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.83 
 
 
239 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  29.09 
 
 
236 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 
263 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
244 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
292 aa  105  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>