More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0706 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.9 
 
 
232 aa  371  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0295505  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.07 
 
 
231 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
233 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
240 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  37.34 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  30.9 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
233 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
261 aa  134  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
243 aa  129  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.7 
 
 
236 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 
242 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05991  short chain dehydrogenase  29.46 
 
 
254 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 
242 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
240 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0535  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
244 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.21 
 
 
239 aa  121  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
261 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1763  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.83 
 
 
243 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3351  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 
242 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
239 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1820  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1866  short chain dehydrogenase  30.25 
 
 
240 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0671437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
246 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
254 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
246 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.56 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  35.48 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0733  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1632  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0693  sepiapterin reductase  29.24 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 
254 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05911  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0596  sepiapterin reductase  31.09 
 
 
243 aa  112  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
252 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05381  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 
235 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
252 aa  111  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0731  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
235 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
256 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
317 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
248 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 
252 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
247 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
239 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 
241 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.75 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.84 
 
 
250 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.84 
 
 
250 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
299 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
233 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
249 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
256 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
245 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
244 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 
245 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
267 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
239 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
244 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.45 
 
 
246 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
256 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
249 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.43 
 
 
260 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
256 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
252 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
244 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
240 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
235 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0764891  hitchhiker  0.00221105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
312 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
235 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
244 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
245 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
238 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 
254 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
252 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
255 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
252 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
253 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>