88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46692 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46692  predicted protein  100 
 
 
566 aa  1155    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39515  predicted protein  39.1 
 
 
623 aa  304  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  31.61 
 
 
459 aa  187  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
477 aa  163  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  27.74 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  27.74 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  32.01 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  29.03 
 
 
469 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  28.8 
 
 
443 aa  139  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  28.8 
 
 
441 aa  138  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  29.84 
 
 
458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  26.76 
 
 
471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  27.36 
 
 
467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  27.27 
 
 
555 aa  126  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  28.63 
 
 
555 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05935  MFS phosphate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10690)  26.76 
 
 
663 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01210  Pi-transporter A-1, putative  25.98 
 
 
729 aa  92  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31573  permease involved in the uptake of glycerophosphoinositol (GroPIns)  23.26 
 
 
508 aa  90.1  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50547  glycerophosphoinositol permease  23.23 
 
 
530 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.89 
 
 
476 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17265  predicted protein  24.52 
 
 
663 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00217  phosphate permease (AFU_orthologue; AFUA_5G01320)  25 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00909973  normal  0.554157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  27.02 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01860  phospholipid transporter, putative  23.15 
 
 
519 aa  75.9  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  23.52 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05549  MFS phospholipid transporter (Git1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07750)  23.03 
 
 
488 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65748  glycerophosphoinositol permease  21.89 
 
 
515 aa  71.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 
508 aa  69.7  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  24.26 
 
 
460 aa  64.3  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  22.79 
 
 
458 aa  61.6  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01612  phosphate transporter (AFU_orthologue; AFUA_4G09210)  27.22 
 
 
664 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0276272 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  25.88 
 
 
427 aa  59.3  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
423 aa  58.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  23.1 
 
 
456 aa  58.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  25.27 
 
 
458 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  28.77 
 
 
456 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  25.27 
 
 
458 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  23.71 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02864  conserved hypothetical protein  21.33 
 
 
473 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  23.43 
 
 
499 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  23.01 
 
 
451 aa  55.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  28.14 
 
 
497 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 
474 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  28.86 
 
 
484 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  22.37 
 
 
438 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  22.68 
 
 
526 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  24.07 
 
 
446 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  25 
 
 
452 aa  51.2  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  24.41 
 
 
446 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  21.68 
 
 
459 aa  51.2  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  34.57 
 
 
479 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  26.27 
 
 
472 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  25.19 
 
 
475 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  21.38 
 
 
438 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  24.72 
 
 
480 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 
451 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 
461 aa  48.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  21.9 
 
 
454 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  28.65 
 
 
454 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03060  myo-inositol transporter, putative  24.35 
 
 
567 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  33.57 
 
 
455 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00040  metabolite transporter, putative  20.93 
 
 
502 aa  47  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  27.74 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04480  membrane transporter, putative  23.05 
 
 
648 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0251444  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  23.29 
 
 
476 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  29.25 
 
 
464 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  24.47 
 
 
477 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 
483 aa  45.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  21.58 
 
 
463 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  26.72 
 
 
471 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
415 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
415 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  20.94 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  23.85 
 
 
463 aa  45.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  23.29 
 
 
457 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
458 aa  44.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  28.67 
 
 
450 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 
472 aa  43.9  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  28.67 
 
 
450 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  21.72 
 
 
474 aa  43.5  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  29.13 
 
 
421 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  28.57 
 
 
456 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 
455 aa  43.9  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  30.61 
 
 
437 aa  43.9  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  28.85 
 
 
436 aa  43.5  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>