More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03060 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH03060  myo-inositol transporter, putative  100 
 
 
567 aa  1152    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00450  myo-inositol transporter 1, putative  82.94 
 
 
586 aa  977    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03420  myo-inositol transporter 1, putative  95.74 
 
 
587 aa  1129    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00990  myo-inositol transporter 2, putative  71.69 
 
 
590 aa  830    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00070  myo-inositol transporter, putative  84.07 
 
 
590 aa  973    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02980  myo-inositol transporter 2, putative  58.4 
 
 
611 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715916  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00020  myo-inositol transporter, putative  58.96 
 
 
545 aa  598  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  41.54 
 
 
567 aa  369  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  38.03 
 
 
528 aa  334  3e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  34.72 
 
 
522 aa  308  1.0000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02465  hypothetical protein  37.89 
 
 
792 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  35.01 
 
 
517 aa  286  7e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27361  predicted protein  27.76 
 
 
655 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  28.15 
 
 
468 aa  188  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  27.95 
 
 
476 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  31.57 
 
 
480 aa  183  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  29.83 
 
 
452 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  30.82 
 
 
477 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  29.91 
 
 
492 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  29.67 
 
 
472 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  28.85 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  28.63 
 
 
472 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  28.63 
 
 
472 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  28.63 
 
 
472 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  28.63 
 
 
472 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  28.63 
 
 
472 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  28.63 
 
 
472 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  28.63 
 
 
472 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  28.63 
 
 
491 aa  171  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  28.41 
 
 
472 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  28.41 
 
 
472 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  28.41 
 
 
472 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  28.41 
 
 
472 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  28.41 
 
 
472 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  28.41 
 
 
472 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  25.6 
 
 
465 aa  167  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  27.02 
 
 
448 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  25.83 
 
 
464 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  25.83 
 
 
464 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  25.83 
 
 
464 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  26.25 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  25.83 
 
 
464 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  25.83 
 
 
464 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  26.87 
 
 
529 aa  164  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  28.73 
 
 
463 aa  164  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  27 
 
 
473 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03210  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01560)  27.49 
 
 
633 aa  163  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0576803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  26.46 
 
 
464 aa  163  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  26.46 
 
 
464 aa  163  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  26.46 
 
 
464 aa  163  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  26.46 
 
 
464 aa  163  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  26.46 
 
 
464 aa  163  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  26.46 
 
 
464 aa  163  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  26.46 
 
 
464 aa  163  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  28.51 
 
 
463 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  29.68 
 
 
447 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  26.43 
 
 
471 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  29.36 
 
 
450 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  27.33 
 
 
473 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  26.04 
 
 
464 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  27.6 
 
 
480 aa  161  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08972  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 
743 aa  160  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  28.6 
 
 
499 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  27.24 
 
 
590 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.39 
 
 
471 aa  157  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  29.59 
 
 
544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  29.13 
 
 
482 aa  156  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48420  fructose symporter  25.91 
 
 
511 aa  156  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.467105  normal  0.26394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  26.57 
 
 
533 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  25.34 
 
 
579 aa  156  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  26.75 
 
 
466 aa  156  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  27.06 
 
 
450 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  25.85 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  26.49 
 
 
507 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  27.78 
 
 
478 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  26.68 
 
 
550 aa  154  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  28.45 
 
 
442 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  27.99 
 
 
472 aa  153  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  29.04 
 
 
497 aa  153  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  25.97 
 
 
550 aa  153  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  29.46 
 
 
497 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  26.07 
 
 
480 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36948  high-affinity hexose (glucose) transporter  27.24 
 
 
525 aa  151  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.046165  normal  0.598705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  30.63 
 
 
475 aa  150  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  30.43 
 
 
486 aa  150  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18469  predicted protein  28.54 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0427076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  27.73 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  29.53 
 
 
449 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  29.76 
 
 
516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  27.02 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  27.02 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  29.65 
 
 
475 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  30.04 
 
 
479 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  26.04 
 
 
457 aa  148  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  28.69 
 
 
480 aa  147  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  27.53 
 
 
441 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  26.58 
 
 
459 aa  147  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  26.01 
 
 
595 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55800  High-affinity Glucose Transporter (putative)  26.35 
 
 
542 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  27.1 
 
 
474 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>