More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_18469 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_18469  predicted protein  100 
 
 		 547 aa  1108    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0427076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  31.46 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  33.86 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  32.04 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  32.04 
 
 		 463 aa  207  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  32.23 
 
 		 472 aa  204  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  31.33 
 
 		 497 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  31.42 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  31.03 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  30 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  33.86 
 
 		 447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  31.72 
 
 		 480 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  31.86 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  30.58 
 
 		 472 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  30.18 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  30.18 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  30.18 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  30.18 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  30.18 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  32.31 
 
 		 475 aa  190  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  29.91 
 
 		 472 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  29.91 
 
 		 472 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  29.46 
 
 		 457 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  29.91 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  29.91 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  29.91 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  29.91 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  29.91 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  29.5 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  29.65 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  32.82 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  29.91 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  32.82 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  30.18 
 
 		 464 aa  187  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  30.18 
 
 		 464 aa  187  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  30.18 
 
 		 464 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  30.18 
 
 		 464 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  30.18 
 
 		 464 aa  187  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  30.18 
 
 		 464 aa  187  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  30.18 
 
 		 464 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  29.69 
 
 		 472 aa  186  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  30.18 
 
 		 464 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  29.95 
 
 		 464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  29.44 
 
 		 442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  27.47 
 
 		 533 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  28.35 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  29.24 
 
 		 472 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  29.24 
 
 		 472 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  29.24 
 
 		 472 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  29.24 
 
 		 472 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  29.24 
 
 		 472 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  27.98 
 
 		 491 aa  183  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  29.17 
 
 		 448 aa  183  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  29.11 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  27.84 
 
 		 491 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  27.84 
 
 		 491 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  27.84 
 
 		 491 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  27.84 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  27.84 
 
 		 491 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  27.84 
 
 		 491 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  30.75 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  30.07 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  30 
 
 		 446 aa  178  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  29.24 
 
 		 516 aa  177  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.43 
 
 		 471 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  27.6 
 
 		 491 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  31.1 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  26.4 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  29.07 
 
 		 480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  29.81 
 
 		 467 aa  173  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  28.73 
 
 		 491 aa  170  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  29.84 
 
 		 468 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  27.74 
 
 		 482 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  28.31 
 
 		 452 aa  169  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  27.53 
 
 		 480 aa  169  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  30.09 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  28.11 
 
 		 473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  28.12 
 
 		 473 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03420  myo-inositol transporter 1, putative  28 
 
 		 587 aa  163  6e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  29.01 
 
 		 448 aa  163  9e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  27.62 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  27.13 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03060  myo-inositol transporter, putative  28.54 
 
 		 567 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  29.33 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  29.43 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  28.57 
 
 		 441 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  27.37 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  27.33 
 
 		 464 aa  160  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1970  sugar transporter  25.98 
 
 		 529 aa  159  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.460324  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00450  myo-inositol transporter 1, putative  26.46 
 
 		 586 aa  158  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  26.8 
 
 		 439 aa  157  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  29.14 
 
 		 567 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  28.51 
 
 		 474 aa  154  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2649  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit 2  25.78 
 
 		 536 aa  154  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123588  normal  0.0278702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  30.02 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  28.54 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  26.79 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  27.14 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00070  myo-inositol transporter, putative  26.09 
 
 		 590 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02980  myo-inositol transporter 2, putative  28.84 
 
 		 611 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>