More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48420 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_48420  fructose symporter  100 
 
 		 511 aa  1043    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.467105  normal  0.26394 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02794  conserved hypothetical protein similar to a fructose transporter (Eurofung)  56.05 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0012636  normal  0.219855 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87108  Arabinose-proton symporter (Arabinose transporter)  30.1 
 
 		 635 aa  206  7e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.132654  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05323  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06870)  27.15 
 
 		 662 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02465  hypothetical protein  32.54 
 
 		 792 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  31.03 
 
 		 528 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  30.56 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  30.7 
 
 		 480 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  33.33 
 
 		 516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  29.14 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03210  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01560)  29.59 
 
 		 633 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0576803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  30.55 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10845  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05830)  27.4 
 
 		 643 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.198608  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 		 561 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02869  galactose-proton symport, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11790)  29.11 
 
 		 631 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.833459  normal  0.61976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  29.31 
 
 		 497 aa  180  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  29.54 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  30.66 
 
 		 550 aa  179  7e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  30.23 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  29.87 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  30.52 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  28.79 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  29.57 
 
 		 474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  30.52 
 
 		 472 aa  174  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  30.5 
 
 		 579 aa  173  5.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  28.22 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  29.48 
 
 		 550 aa  173  5.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  28.96 
 
 		 507 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  30.3 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  30.3 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  30.3 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  30.3 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03980  hexose transport-related protein, putative  28.25 
 
 		 647 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804864  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  28.09 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06804  conserved hypothetical protein  28.94 
 
 		 619 aa  170  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408533  normal  0.253031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  30.09 
 
 		 472 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  27.21 
 
 		 480 aa  169  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  30.09 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  30.09 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01276  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09910)  28.03 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.438181 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05060  hexose transport-related protein, putative  28.73 
 
 		 630 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02990  sugar transporter, putative  28.63 
 
 		 634 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39560  sugar transporter, putative  28.85 
 
 		 551 aa  167  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0538769 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  28.1 
 
 		 480 aa  167  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  29.61 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  29.87 
 
 		 472 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  29.87 
 
 		 472 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  29.87 
 
 		 472 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  29.87 
 
 		 472 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  28.67 
 
 		 465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00450  myo-inositol transporter 1, putative  27.2 
 
 		 586 aa  166  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  29.87 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  27.66 
 
 		 561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  27.56 
 
 		 475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  28.13 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  26.39 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  28.13 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  28.13 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  28.13 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  28.13 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  27.29 
 
 		 533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00990  myo-inositol transporter 2, putative  27.47 
 
 		 590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  26.67 
 
 		 468 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  28.57 
 
 		 464 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  26.93 
 
 		 567 aa  163  6e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03420  myo-inositol transporter 1, putative  25.86 
 
 		 587 aa  163  6e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  27.51 
 
 		 452 aa  163  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00070  myo-inositol transporter, putative  27.59 
 
 		 590 aa  163  8.000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  30.28 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  28.35 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  28.35 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  28.35 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  28.35 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  28.35 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  28.35 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  28.35 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  29.01 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  27.38 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  28.35 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  28.74 
 
 		 590 aa  160  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  29.04 
 
 		 482 aa  160  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  29.84 
 
 		 566 aa  159  9e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  29.04 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  28.35 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  29.78 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  28.02 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  26.97 
 
 		 490 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  29.98 
 
 		 456 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02980  myo-inositol transporter 2, putative  27.08 
 
 		 611 aa  157  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715916  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03060  myo-inositol transporter, putative  25.91 
 
 		 567 aa  156  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  26.65 
 
 		 517 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2375  sugar transporter  30.13 
 
 		 489 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00427288  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00250  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14442)  27.08 
 
 		 547 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  31.43 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  29.71 
 
 		 509 aa  153  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  26.71 
 
 		 529 aa  153  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  28.26 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  28.29 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  28.26 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  29.18 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>