More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33008 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  100 
 
 
566 aa  1144    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00250  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14442)  49.82 
 
 
547 aa  558  1e-158  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  47.41 
 
 
550 aa  465  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  45.81 
 
 
550 aa  466  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03400  hexose transport-related protein, putative  46.84 
 
 
535 aa  464  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08340  hexose transport-related protein, putative  40.82 
 
 
550 aa  459  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  40.71 
 
 
561 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  41.23 
 
 
561 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39560  sugar transporter, putative  40.64 
 
 
551 aa  392  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0538769 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03233  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14670)  38.94 
 
 
517 aa  359  7e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02585  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05190)  37.84 
 
 
499 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.253437 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00070  monosaccharide transporter, putative  35.74 
 
 
590 aa  347  3e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  35.51 
 
 
595 aa  344  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  33.33 
 
 
579 aa  343  5e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  35.38 
 
 
590 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04310  monosaccharide transporter, putative  35.97 
 
 
591 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  35.12 
 
 
524 aa  281  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07667  conserved hypothetical protein  31.32 
 
 
512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.341465 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02466  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14170)  32.94 
 
 
536 aa  270  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04277  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  33.82 
 
 
584 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.851042  normal  0.103558 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05104  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07700)  33.6 
 
 
576 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0144049  hitchhiker  0.00149978 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03220  receptor, putative  31.95 
 
 
561 aa  264  4e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630871  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08737  MSTA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J220]  30.91 
 
 
527 aa  263  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.187861  normal  0.100961 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01276  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09910)  32.24 
 
 
504 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.438181 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33971  Sugar transporter, putative (STL12)  35.4 
 
 
544 aa  259  8e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02730  sugar transporter, putative  32.4 
 
 
545 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  31.12 
 
 
534 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  31.12 
 
 
529 aa  248  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06923  High-affinity hexose transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874U9]  29.64 
 
 
531 aa  246  9e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55800  High-affinity Glucose Transporter (putative)  31.68 
 
 
542 aa  244  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39517  xylose transporter, high affinity, putative similarity to STL13  36.7 
 
 
417 aa  243  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000189877  normal  0.584414 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05860  Putative low affinity glucose transporter MstE [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q400D8]  31.57 
 
 
562 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0426596 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09184  conserved hypothetical protein  30.36 
 
 
531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_16856  high affinity xylose transporter (putative) (HGT3)  33.11 
 
 
529 aa  240  5.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0752816  normal  0.401981 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91253  glucose transporter/sensor  31.97 
 
 
528 aa  239  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02958  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06720)  31.77 
 
 
520 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.280694 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02680  glucose transporter, putative  32.55 
 
 
552 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08972  conserved hypothetical protein  29.14 
 
 
743 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57820  sugar transporter  31.41 
 
 
529 aa  231  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00705004  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03357  Putative monosaccharide sugar transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5F2L5]  30.88 
 
 
550 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.205094  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01480  hexose transport-related protein, putative  29.76 
 
 
520 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85501  High-affinity glucose transporter  31.65 
 
 
747 aa  228  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0464607  normal  0.964846 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09168  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  27.88 
 
 
543 aa  228  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.050203  normal  0.0522811 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00260  sugar transporter, putative  31.73 
 
 
542 aa  228  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02665  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02010)  32.53 
 
 
541 aa  227  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01797  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  28.7 
 
 
512 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000141005  normal  0.63949 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04630  conserved hypothetical protein  33.27 
 
 
499 aa  225  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09173  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00890)  32.33 
 
 
500 aa  224  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  34 
 
 
480 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  33.27 
 
 
492 aa  223  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05050  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12170)  31.9 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00148453  hitchhiker  0.00000000414532 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10891  Putative hexose transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2WBH1]  31.06 
 
 
535 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.148796  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04148  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13080)  28.52 
 
 
548 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.900838  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  33.85 
 
 
477 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11029  conserved hypothetical protein  29.98 
 
 
513 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00120  sugar transporter, putative  31.88 
 
 
539 aa  217  5e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.891292  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00490  sugar transporter, putative  29.47 
 
 
592 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.75075  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01138  Quinate permease (Quinate transporter) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P15325]  28.43 
 
 
533 aa  213  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06848  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12950)  28.96 
 
 
563 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.817086  normal  0.150124 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00020  glucose transporter, putative  29.73 
 
 
519 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05551  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 
500 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66414  hexose transporter  30.58 
 
 
553 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.730098  normal  0.0488082 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  30.74 
 
 
491 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40173  Sugar transporter  30 
 
 
468 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  30.21 
 
 
491 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10658  hypothetical protein  31.03 
 
 
519 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77210  quinate permease  26.14 
 
 
594 aa  208  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.436623  normal  0.677517 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  30.41 
 
 
458 aa  207  6e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06098  conserved hypothetical protein  31.69 
 
 
351 aa  206  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00927038 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01540  hexose transport-related protein, putative  29.66 
 
 
557 aa  206  7e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  30.21 
 
 
491 aa  206  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  30.21 
 
 
491 aa  206  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  30.21 
 
 
491 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  30.21 
 
 
491 aa  206  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  30.21 
 
 
491 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_27984  Sugar UpTake (tentative)  30.8 
 
 
550 aa  206  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  30.39 
 
 
468 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  29.75 
 
 
459 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02974  conserved hypothetical protein  29.81 
 
 
477 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_27983  Sugar UpTake (tentative)  30.8 
 
 
550 aa  205  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180127  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64741  sugar transporter protein  30.72 
 
 
550 aa  204  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402333  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  30.29 
 
 
491 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  31.36 
 
 
446 aa  204  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08464  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 
461 aa  203  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  28.94 
 
 
468 aa  203  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05200  hexose transport-related protein, putative  28.23 
 
 
535 aa  203  7e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  31.19 
 
 
476 aa  203  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06805  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  29.46 
 
 
507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  30.23 
 
 
466 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  32.93 
 
 
484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08084  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 
430 aa  200  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  30.45 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  29.84 
 
 
472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  29.84 
 
 
472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04590  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02110)  28.18 
 
 
554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  29.94 
 
 
472 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  29.94 
 
 
472 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  29.94 
 
 
472 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  30.14 
 
 
465 aa  198  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>