More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39560 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_39560  sugar transporter, putative  100 
 
 
551 aa  1122    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0538769 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  64.02 
 
 
561 aa  701    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  39.93 
 
 
561 aa  396  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  40.27 
 
 
550 aa  399  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  39.5 
 
 
550 aa  392  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  40.64 
 
 
566 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00250  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14442)  40.19 
 
 
547 aa  385  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03400  hexose transport-related protein, putative  38.79 
 
 
535 aa  383  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08340  hexose transport-related protein, putative  38.16 
 
 
550 aa  376  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02585  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05190)  36.81 
 
 
499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.253437 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  34.01 
 
 
595 aa  324  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  34.63 
 
 
590 aa  324  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00070  monosaccharide transporter, putative  35.03 
 
 
590 aa  317  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  33.58 
 
 
579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04310  monosaccharide transporter, putative  35.59 
 
 
591 aa  306  7e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03233  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14670)  32.29 
 
 
517 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07667  conserved hypothetical protein  33.15 
 
 
512 aa  292  9e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.341465 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01276  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09910)  31.26 
 
 
504 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.438181 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05104  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07700)  32.87 
 
 
576 aa  267  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0144049  hitchhiker  0.00149978 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01138  Quinate permease (Quinate transporter) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P15325]  31.91 
 
 
533 aa  257  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  32.41 
 
 
524 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03220  receptor, putative  31.89 
 
 
561 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630871  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  32.16 
 
 
534 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02466  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14170)  29.57 
 
 
536 aa  250  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06923  High-affinity hexose transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874U9]  30.48 
 
 
531 aa  247  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00490  sugar transporter, putative  30.6 
 
 
592 aa  246  9e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.75075  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01797  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  31.78 
 
 
512 aa  245  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000141005  normal  0.63949 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91253  glucose transporter/sensor  33.13 
 
 
528 aa  245  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08972  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 
743 aa  246  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08737  MSTA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J220]  31.52 
 
 
527 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.187861  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57820  sugar transporter  30.19 
 
 
529 aa  243  9e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00705004  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  33.27 
 
 
474 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04148  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13080)  32.17 
 
 
548 aa  240  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.900838  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02730  sugar transporter, putative  31.07 
 
 
545 aa  236  8e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02910  hexose transport-related protein, putative  32.75 
 
 
545 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01865  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04550)  30.08 
 
 
490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05200  hexose transport-related protein, putative  29.63 
 
 
535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02680  glucose transporter, putative  33.72 
 
 
552 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08084  conserved hypothetical protein  32.53 
 
 
430 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00020  glucose transporter, putative  30.26 
 
 
519 aa  233  7.000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.13 
 
 
468 aa  233  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33971  Sugar transporter, putative (STL12)  32.5 
 
 
544 aa  231  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04630  conserved hypothetical protein  31.55 
 
 
499 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55800  High-affinity Glucose Transporter (putative)  28.98 
 
 
542 aa  230  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06848  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12950)  30.45 
 
 
563 aa  230  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.817086  normal  0.150124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  31.12 
 
 
447 aa  229  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  31.75 
 
 
492 aa  229  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06805  conserved hypothetical protein  31.64 
 
 
549 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  30.81 
 
 
529 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77210  quinate permease  29.41 
 
 
594 aa  227  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.436623  normal  0.677517 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00120  sugar transporter, putative  31.38 
 
 
539 aa  226  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.891292  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00260  sugar transporter, putative  29.51 
 
 
542 aa  224  3e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  32.49 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05551  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09184  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  31.33 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  31.33 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09168  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  28.46 
 
 
543 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.050203  normal  0.0522811 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  30.86 
 
 
458 aa  221  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05050  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12170)  31.1 
 
 
495 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00148453  hitchhiker  0.00000000414532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  31.63 
 
 
464 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  32.04 
 
 
477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  31.58 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  31.58 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  31.58 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  31.58 
 
 
464 aa  217  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  31.58 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  31.58 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  31.58 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  31.5 
 
 
491 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  31.44 
 
 
464 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  31.44 
 
 
464 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  31.44 
 
 
464 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  31.44 
 
 
464 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  31.44 
 
 
464 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04277  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  28.15 
 
 
584 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.851042  normal  0.103558 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  29.84 
 
 
471 aa  216  7e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05860  Putative low affinity glucose transporter MstE [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q400D8]  30.3 
 
 
562 aa  216  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0426596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  31.39 
 
 
464 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39517  xylose transporter, high affinity, putative similarity to STL13  32.84 
 
 
417 aa  216  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000189877  normal  0.584414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  30.22 
 
 
476 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85501  High-affinity glucose transporter  30.84 
 
 
747 aa  215  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0464607  normal  0.964846 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02665  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02010)  28.54 
 
 
541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  31.57 
 
 
491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  30.06 
 
 
473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  31.57 
 
 
491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  31.57 
 
 
491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  31.57 
 
 
491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  31.57 
 
 
491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  30.56 
 
 
463 aa  214  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  31.57 
 
 
491 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  33.13 
 
 
478 aa  214  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  29.72 
 
 
473 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40173  Sugar transporter  29.88 
 
 
468 aa  213  5.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  31.56 
 
 
465 aa  213  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  30.36 
 
 
463 aa  212  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  31.36 
 
 
459 aa  211  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_16856  high affinity xylose transporter (putative) (HGT3)  30.5 
 
 
529 aa  210  6e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0752816  normal  0.401981 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  30.49 
 
 
472 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  30.49 
 
 
472 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>