More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05060 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB05060  hexose transport-related protein, putative  100 
 
 
630 aa  1303    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02869  galactose-proton symport, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11790)  50.33 
 
 
631 aa  625  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.833459  normal  0.61976 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02990  sugar transporter, putative  46.36 
 
 
634 aa  548  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06804  conserved hypothetical protein  48.85 
 
 
619 aa  538  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408533  normal  0.253031 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10845  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05830)  42.72 
 
 
643 aa  472  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.198608  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05323  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06870)  40 
 
 
662 aa  452  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03210  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01560)  39.47 
 
 
633 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0576803 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87108  Arabinose-proton symporter (Arabinose transporter)  39.17 
 
 
635 aa  422  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.132654  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03980  hexose transport-related protein, putative  41.21 
 
 
647 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804864  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10812  conserved hypothetical protein  33.28 
 
 
636 aa  294  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02372  conserved hypothetical protein  33.81 
 
 
523 aa  217  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.366103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  31.65 
 
 
468 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  32.5 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  29.4 
 
 
465 aa  173  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  31.03 
 
 
507 aa  170  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  29.28 
 
 
471 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  29.4 
 
 
464 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  29.4 
 
 
464 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  29.4 
 
 
464 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  29.4 
 
 
464 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  29.4 
 
 
464 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48420  fructose symporter  28.73 
 
 
511 aa  168  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.467105  normal  0.26394 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  29.2 
 
 
464 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  29.01 
 
 
482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  28.66 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  28.66 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  28.66 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  28.66 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  28.66 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  28.66 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  28.66 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  28.66 
 
 
464 aa  165  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  28.2 
 
 
472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  29.9 
 
 
472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  29.9 
 
 
472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  29.9 
 
 
472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  29.9 
 
 
472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  29.68 
 
 
472 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  27.98 
 
 
472 aa  163  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  29.15 
 
 
476 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  27.98 
 
 
472 aa  163  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  29.95 
 
 
446 aa  163  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  30.11 
 
 
490 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  27.98 
 
 
472 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  27.98 
 
 
472 aa  162  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  27.98 
 
 
472 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  27.98 
 
 
472 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  27.73 
 
 
567 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  27.98 
 
 
472 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  27.98 
 
 
472 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  30.7 
 
 
480 aa  161  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  29.23 
 
 
492 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  27.88 
 
 
482 aa  160  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  29.09 
 
 
480 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  29.48 
 
 
450 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  29.95 
 
 
472 aa  159  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  28.92 
 
 
464 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  32.11 
 
 
468 aa  157  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28497  quinate permease  28.08 
 
 
569 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.039744  normal  0.208592 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  29.82 
 
 
524 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  30.45 
 
 
447 aa  152  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  27.69 
 
 
444 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  25.48 
 
 
517 aa  151  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  27.68 
 
 
471 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  27.68 
 
 
471 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  28.03 
 
 
452 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  28.51 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04277  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  26.07 
 
 
584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.851042  normal  0.103558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  27.72 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  27.96 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  28.67 
 
 
561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  28.32 
 
 
473 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  27.77 
 
 
480 aa  148  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  25.31 
 
 
533 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57820  sugar transporter  28.42 
 
 
529 aa  148  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00705004  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 
561 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  29.48 
 
 
468 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  27.23 
 
 
471 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  28.6 
 
 
482 aa  146  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  28.94 
 
 
439 aa  146  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  27.06 
 
 
474 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05860  Putative low affinity glucose transporter MstE [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q400D8]  27 
 
 
562 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0426596 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08340  hexose transport-related protein, putative  29.86 
 
 
550 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03357  Putative monosaccharide sugar transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5F2L5]  27.44 
 
 
550 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.205094  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  27.91 
 
 
472 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  27.77 
 
 
566 aa  144  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  28.03 
 
 
443 aa  144  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  28.27 
 
 
467 aa  143  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  28.35 
 
 
438 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  26.42 
 
 
441 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  27.49 
 
 
452 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  27.49 
 
 
452 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  26.46 
 
 
478 aa  141  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66414  hexose transporter  25.7 
 
 
553 aa  140  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.730098  normal  0.0488082 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_27983  Sugar UpTake (tentative)  28.4 
 
 
550 aa  140  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180127  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  28.67 
 
 
509 aa  140  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_27984  Sugar UpTake (tentative)  28.4 
 
 
550 aa  140  8.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  28.38 
 
 
480 aa  140  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02730  sugar transporter, putative  26.53 
 
 
545 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64741  sugar transporter protein  28.4 
 
 
550 aa  140  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>