More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02990 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06804  conserved hypothetical protein  73.23 
 
 
619 aa  933    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408533  normal  0.253031 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02990  sugar transporter, putative  100 
 
 
634 aa  1313    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02869  galactose-proton symport, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11790)  46.67 
 
 
631 aa  547  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.833459  normal  0.61976 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05060  hexose transport-related protein, putative  46.36 
 
 
630 aa  548  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10845  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05830)  40.48 
 
 
643 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.198608  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05323  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06870)  39.19 
 
 
662 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87108  Arabinose-proton symporter (Arabinose transporter)  39.8 
 
 
635 aa  423  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.132654  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03980  hexose transport-related protein, putative  37.75 
 
 
647 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804864  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03210  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01560)  35.25 
 
 
633 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0576803 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10812  conserved hypothetical protein  31.49 
 
 
636 aa  267  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02372  conserved hypothetical protein  31.56 
 
 
523 aa  203  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.366103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  30.3 
 
 
507 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  30.94 
 
 
450 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  31.34 
 
 
477 aa  173  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  30.38 
 
 
480 aa  170  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  28.78 
 
 
472 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48420  fructose symporter  28.63 
 
 
511 aa  167  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.467105  normal  0.26394 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  28.57 
 
 
472 aa  167  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  28.57 
 
 
472 aa  166  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  28.57 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  28.57 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  28.57 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  28.57 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08340  hexose transport-related protein, putative  31.19 
 
 
550 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  30.54 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  29.09 
 
 
471 aa  165  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  29.78 
 
 
492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  28.85 
 
 
472 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  28.85 
 
 
472 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  28.85 
 
 
472 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  28.85 
 
 
472 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  26.09 
 
 
533 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  28.85 
 
 
472 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  28.36 
 
 
472 aa  163  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  28.36 
 
 
472 aa  163  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02794  conserved hypothetical protein similar to a fructose transporter (Eurofung)  32.08 
 
 
409 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0012636  normal  0.219855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  28.19 
 
 
472 aa  160  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  28.13 
 
 
457 aa  159  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  29.4 
 
 
482 aa  159  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  28.7 
 
 
490 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  28.06 
 
 
467 aa  158  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  28.78 
 
 
567 aa  157  6e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  27.87 
 
 
491 aa  156  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  28.79 
 
 
452 aa  156  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 
561 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  26.27 
 
 
468 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  26.55 
 
 
476 aa  155  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  29.17 
 
 
480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  30.02 
 
 
590 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  28.32 
 
 
524 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  28.54 
 
 
468 aa  153  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  30.77 
 
 
550 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  29.31 
 
 
482 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  30.64 
 
 
448 aa  151  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01540  hexose transport-related protein, putative  28.03 
 
 
557 aa  150  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  27.58 
 
 
482 aa  150  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  28.24 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  26.04 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  29.91 
 
 
466 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  29.44 
 
 
444 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  29.27 
 
 
447 aa  148  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  29.93 
 
 
468 aa  147  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  27.04 
 
 
474 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  29.52 
 
 
442 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  28.38 
 
 
561 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03357  Putative monosaccharide sugar transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5F2L5]  30.95 
 
 
550 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.205094  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  27.98 
 
 
566 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  29.82 
 
 
463 aa  145  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  29.82 
 
 
463 aa  145  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  29.05 
 
 
487 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  28.1 
 
 
472 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  28.02 
 
 
471 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  27.41 
 
 
441 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  28.02 
 
 
471 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  28.02 
 
 
471 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  29.02 
 
 
450 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  27.75 
 
 
452 aa  143  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  27.75 
 
 
452 aa  143  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11029  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 
513 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  26.39 
 
 
464 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  26.39 
 
 
464 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  26.39 
 
 
464 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  26.39 
 
 
464 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  26.39 
 
 
464 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  28.93 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  28.68 
 
 
473 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  28.76 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77210  quinate permease  27.84 
 
 
594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.436623  normal  0.677517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  26.15 
 
 
464 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02910  hexose transport-related protein, putative  27.27 
 
 
545 aa  142  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  28.25 
 
 
550 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  28.4 
 
 
438 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08084  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 
430 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  27.1 
 
 
464 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2136  sugar transporter  30.98 
 
 
447 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  27.8 
 
 
579 aa  140  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  27.39 
 
 
473 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  26.74 
 
 
473 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04277  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  29.06 
 
 
584 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.851042  normal  0.103558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  25.93 
 
 
464 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>