More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00020 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND00020  myo-inositol transporter, putative  100 
 
 
545 aa  1105    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02980  myo-inositol transporter 2, putative  61.08 
 
 
611 aa  632  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715916  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03420  myo-inositol transporter 1, putative  60.99 
 
 
587 aa  623  1e-177  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00990  myo-inositol transporter 2, putative  62.3 
 
 
590 aa  617  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00450  myo-inositol transporter 1, putative  59.24 
 
 
586 aa  605  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03060  myo-inositol transporter, putative  58.96 
 
 
567 aa  598  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00070  myo-inositol transporter, putative  56.93 
 
 
590 aa  597  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  41.24 
 
 
567 aa  382  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  37.36 
 
 
528 aa  347  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02465  hypothetical protein  39.83 
 
 
792 aa  317  5e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  31.24 
 
 
522 aa  276  5e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  31.27 
 
 
517 aa  272  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  31.42 
 
 
492 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  31.51 
 
 
477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  31.16 
 
 
480 aa  210  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  32.26 
 
 
452 aa  200  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  31.14 
 
 
472 aa  194  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.44 
 
 
478 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  30.45 
 
 
447 aa  189  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  30.8 
 
 
499 aa  189  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  32.24 
 
 
482 aa  187  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  28.75 
 
 
544 aa  187  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  30.72 
 
 
448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  29.42 
 
 
463 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  29.65 
 
 
466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  29.42 
 
 
463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  31.84 
 
 
467 aa  184  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  32.44 
 
 
486 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  30.64 
 
 
472 aa  181  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  30.12 
 
 
497 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  27.59 
 
 
468 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  27.47 
 
 
550 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  27.72 
 
 
476 aa  179  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  27.88 
 
 
472 aa  177  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  28.09 
 
 
550 aa  176  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  28.54 
 
 
533 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  31.32 
 
 
475 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  27.68 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  27.68 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  27.68 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  27.68 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  27.68 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  27.68 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  28.96 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  27.68 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  28.42 
 
 
471 aa  174  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  29.07 
 
 
459 aa  173  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  28.78 
 
 
497 aa  173  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  27.47 
 
 
472 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  27.91 
 
 
472 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  27.91 
 
 
472 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  27.91 
 
 
472 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  27.91 
 
 
472 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  28.82 
 
 
446 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  28.74 
 
 
487 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  30.44 
 
 
449 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  30.39 
 
 
485 aa  171  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  28.57 
 
 
448 aa  171  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  27.7 
 
 
472 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  30.84 
 
 
486 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  29.87 
 
 
491 aa  170  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  28.17 
 
 
442 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  29.14 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85501  High-affinity glucose transporter  30.06 
 
 
747 aa  167  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0464607  normal  0.964846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  28.03 
 
 
507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  30.52 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  27.1 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  27.1 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  29.87 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  27.1 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  27.1 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  27.1 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  29.09 
 
 
472 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1619  hypothetical protein  29.26 
 
 
471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  29.06 
 
 
490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  27.93 
 
 
452 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  27.93 
 
 
452 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  27 
 
 
473 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  28.27 
 
 
469 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  28.51 
 
 
480 aa  162  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  25.68 
 
 
471 aa  162  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  28.98 
 
 
480 aa  161  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  26.7 
 
 
473 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  28.11 
 
 
474 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08972  conserved hypothetical protein  28.04 
 
 
743 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27361  predicted protein  28.78 
 
 
655 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  27.62 
 
 
482 aa  160  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03400  hexose transport-related protein, putative  27.08 
 
 
535 aa  160  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08464  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 
461 aa  160  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  29.49 
 
 
479 aa  160  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  29.96 
 
 
471 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  27.88 
 
 
480 aa  159  8e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  28.63 
 
 
480 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  26.67 
 
 
493 aa  160  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  27.55 
 
 
504 aa  160  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  27.06 
 
 
480 aa  160  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  27.54 
 
 
464 aa  159  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  30 
 
 
524 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  29.21 
 
 
479 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  26.9 
 
 
457 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>