More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14607 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14607  predicted protein  100 
 
 
337 aa  690    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_432  predicted protein  35.43 
 
 
829 aa  210  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0880854  normal  0.487842 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06316  ATP-binding protein (Eurofung)  29.94 
 
 
1228 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02500  ATPase, putative  32.18 
 
 
939 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.791376  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58454  predicted protein  27.95 
 
 
809 aa  149  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0929212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  27.59 
 
 
586 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  31.12 
 
 
762 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 
705 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  28.57 
 
 
603 aa  122  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  30.63 
 
 
604 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 
684 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 
684 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 
684 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 
684 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 
681 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 
681 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 
684 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  27.54 
 
 
611 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51248  predicted protein  30.51 
 
 
722 aa  119  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0753689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  31.15 
 
 
645 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  30.31 
 
 
648 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  32.17 
 
 
582 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  29.12 
 
 
765 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  29.73 
 
 
662 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  29.59 
 
 
657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  30.18 
 
 
657 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3218  DNA mismatch repair protein MutL  28.16 
 
 
738 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  30.22 
 
 
633 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  30.33 
 
 
661 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  29.91 
 
 
632 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00126  DNA mismatch repair protein Mlh1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11700)  26.99 
 
 
744 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621771  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  29.79 
 
 
651 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  32.32 
 
 
540 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89086  predicted protein  27.51 
 
 
736 aa  115  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  30.22 
 
 
632 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  27.54 
 
 
730 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  29 
 
 
603 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 
667 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 
667 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  30.03 
 
 
661 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 
667 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 
661 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  30.95 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  30.52 
 
 
698 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  30.12 
 
 
617 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  28.78 
 
 
566 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  32.14 
 
 
595 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  30.79 
 
 
674 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  32.14 
 
 
595 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  29.53 
 
 
709 aa  112  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  30.12 
 
 
612 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  29.71 
 
 
652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  29.73 
 
 
687 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  29.22 
 
 
622 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  29.19 
 
 
566 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 
691 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  30.06 
 
 
635 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  28.78 
 
 
566 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  29.43 
 
 
688 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  26.71 
 
 
584 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  29.97 
 
 
633 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  29.2 
 
 
557 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  30.6 
 
 
626 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  30.45 
 
 
560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  30.52 
 
 
641 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  29.28 
 
 
633 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  29.65 
 
 
623 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  29.88 
 
 
561 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  29.34 
 
 
633 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  29.88 
 
 
561 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  29.78 
 
 
590 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  29.22 
 
 
632 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  29.91 
 
 
635 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  25.66 
 
 
695 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0864  DNA mismatch repair protein  29.03 
 
 
576 aa  107  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 
647 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  28.57 
 
 
585 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  28.27 
 
 
680 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  31.45 
 
 
532 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 
650 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  28.15 
 
 
660 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  29.57 
 
 
621 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2752  DNA mismatch repair protein MutL  26.63 
 
 
576 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  29.43 
 
 
636 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2625  DNA mismatch repair protein MutL  26.63 
 
 
576 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  30.24 
 
 
620 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  28.66 
 
 
644 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0226  DNA mismatch repair protein MutL  26.46 
 
 
608 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0607304  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  28.4 
 
 
617 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  29.1 
 
 
644 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  28.3 
 
 
516 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  29.62 
 
 
655 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 
603 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  28.83 
 
 
635 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  25.22 
 
 
589 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  27.97 
 
 
650 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  28.93 
 
 
516 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  29.08 
 
 
565 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  27.71 
 
 
588 aa  102  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  25.22 
 
 
621 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>