More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1923 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 183 aa  368  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  65.75 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  61.41 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  64.09 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  59.24 
 
 		 184 aa  227  8e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05795  50S ribosomal protein L6  62.43 
 
 		 180 aa  227  9e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  56.52 
 
 		 185 aa  220  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  57.61 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  59.46 
 
 		 184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  57.61 
 
 		 184 aa  215  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  51.37 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  52.46 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.04 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  50.83 
 
 		 181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  48.63 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 179 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  49.18 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  49.18 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50.27 
 
 		 178 aa  174  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  48.65 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  48.39 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 187 aa  170  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  170  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  48.11 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  46.41 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  46.41 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 178 aa  167  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 178 aa  167  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  47.8 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  48.62 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  48.62 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  45.25 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  45.25 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  47.28 
 
 		 179 aa  167  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  47.8 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  48.89 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  47.51 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  45.25 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  49.17 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  45.11 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0246  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  48.39 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  50 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2357  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.700236  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 182 aa  164  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0214  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000958159  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0209  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000225303  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  45.95 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  44.68 
 
 		 184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  44.68 
 
 		 184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  49.13 
 
 		 184 aa  164  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 179 aa  164  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 178 aa  164  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  46.11 
 
 		 178 aa  164  9e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  47.25 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1018  50S ribosomal protein L6  47.03 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000674747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>