209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3401 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 345 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  40.86 
 
 		 333 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  35.71 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  33.46 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  28.28 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  27.12 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  23.86 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  36.79 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  20.27 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1169  hypothetical protein  39.47 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242801  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  41.56 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 408 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  36.56 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  36.56 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  27.5 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  38.46 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  35.42 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  36.26 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  32.98 
 
 		 409 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  30.1 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  32.65 
 
 		 277 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  46 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  28.1 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  36.14 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.56 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  36.27 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  30.77 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  31.52 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  29.31 
 
 		 272 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  28.1 
 
 		 271 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  39.73 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  39.73 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 260 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  48.98 
 
 		 260 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  51.02 
 
 		 251 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  30.53 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  32.53 
 
 		 275 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  36.07 
 
 		 264 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  30.39 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 268 aa  49.7  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  24.83 
 
 		 308 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  45.45 
 
 		 277 aa  49.7  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  34.83 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7186  VIC family transporter: potassium ion channel  41.07 
 
 		 189 aa  49.3  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  40.23 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  34.48 
 
 		 231 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  31.25 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  26 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  28.21 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  30.34 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  28.16 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  33.82 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  38.6 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  40 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  26.89 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  40.68 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  28.48 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  23.23 
 
 		 1206 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  38.16 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  29.08 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  30.88 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  36.49 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  27.84 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  34.43 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 531 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01080  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 		 554 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  31.4 
 
 		 271 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0076  extracellular solute-binding protein  33.75 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  30.49 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  29.81 
 
 		 263 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  36.67 
 
 		 280 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.36 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  31.53 
 
 		 272 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0098  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.62 
 
 		 487 aa  47  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86010  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily B VIC  44.44 
 
 		 513 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  27.47 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  27.88 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>