81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1304 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  749    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  37.33 
 
 		 393 aa  224  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  37.92 
 
 		 408 aa  222  8e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  39.4 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  25.42 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 		 433 aa  79.3  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  26.29 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.81 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  23.81 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  23.9 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.98 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.33 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  20.53 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  25.19 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  24.9 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  21.95 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 398 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  28.21 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  21.98 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  25 
 
 		 274 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  23.35 
 
 		 529 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  25 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  25.57 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  23.99 
 
 		 507 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  21.29 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  22.62 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  21.29 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  21.29 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  26.39 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 437 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 384 aa  46.2  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  26 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 438 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  32.32 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>