111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0215 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  29.1 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  28.06 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  28.06 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  26.82 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  21.81 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  27.84 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  23.13 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  21.74 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  36.73 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  24.24 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  26.42 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.42 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.42 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.42 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.42 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.42 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.42 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  26.42 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  21.64 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.92 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.78 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  28.39 
 
 		 181 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0896  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00832617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.92 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.92 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.92 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.42 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  28.09 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  23.21 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  18.68 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.47 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.92 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.23 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25.23 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  26.52 
 
 		 289 aa  42.4  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 187 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>