216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3636 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3636  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
375 aa  757    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1530  aminoglycoside phosphotransferase  62.19 
 
 
373 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.984982  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1560  aminoglycoside phosphotransferase  61.64 
 
 
373 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1584  aminoglycoside phosphotransferase  61.64 
 
 
373 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13189  hypothetical protein  59.45 
 
 
378 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.23318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1869  aminoglycoside phosphotransferase  59.26 
 
 
378 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0573919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4497  aminoglycoside phosphotransferase  58.85 
 
 
382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609901  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4604  aminoglycoside phosphotransferase  55.59 
 
 
381 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7694  aminoglycoside phosphotransferase  47.57 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2683  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  44.88 
 
 
372 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.124499  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3974  aminoglycoside phosphotransferase  36.5 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4048  aminoglycoside phosphotransferase  31.51 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  0.325944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0624  aminoglycoside phosphotransferase  32.3 
 
 
355 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  29.36 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 
366 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 
366 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  30.54 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  32.52 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  30.24 
 
 
346 aa  89.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  31.1 
 
 
337 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  26.91 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  27.37 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  32.98 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.65 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  30.25 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  31.69 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  29.27 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  27.11 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  27.55 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  28.24 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  24.61 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  24.61 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  27.56 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  32.14 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  28.4 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  26.86 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  30.27 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  26.61 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  29.96 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  26.58 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  28.29 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  29.66 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  27.73 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  30.57 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  26.87 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  27.57 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  28.19 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  26.43 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  24.9 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  27.69 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  26.07 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  26.27 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  26.64 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  29.61 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  24.9 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  26.92 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  26.86 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  25.63 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  26.42 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  29.08 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  26.05 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  28.62 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  25.78 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  25.09 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  25.76 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  26.21 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  27.07 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  30.04 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  25.14 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  28 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  25.82 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  27.04 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  24.85 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  28.44 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  27.04 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  29.54 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  28.98 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  29.39 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  28.98 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  25.17 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  29.39 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  25.1 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  29.39 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  29.39 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  28.94 
 
 
876 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  26.48 
 
 
362 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  29.71 
 
 
361 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  28.92 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  25.63 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  25.14 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  29.82 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>