More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2622 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2622  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 412 aa  822    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  40.44 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.81 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.81 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  40.81 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  40.81 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.81 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  40.81 
 
 		 449 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  40.81 
 
 		 449 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 		 460 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.55 
 
 		 450 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  39.7 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  40.24 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  37.05 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  39.55 
 
 		 451 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  35.84 
 
 		 451 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  34.99 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  38.48 
 
 		 458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  37.56 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  38.26 
 
 		 462 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  37.32 
 
 		 505 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  37.32 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  37.72 
 
 		 457 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  37.08 
 
 		 461 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  36.42 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 		 457 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  35.28 
 
 		 426 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2876  MscS mechanosensitive ion channel  35.28 
 
 		 456 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  32.91 
 
 		 435 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  36.11 
 
 		 447 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2167  MscS mechanosensitive ion channel  38.2 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.880536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  34.1 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 452 aa  176  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  27.57 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  27.87 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 		 322 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  32.01 
 
 		 479 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  30.83 
 
 		 291 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.8 
 
 		 806 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 432 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 637 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 475 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 843 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  31.65 
 
 		 1107 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 1107 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1107 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1107 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1107 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1108 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1107 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1107 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1115 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1107 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1108 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1108 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1108 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1107 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1108 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.69 
 
 		 1144 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 685 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1103 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 636 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 636 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 860 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  30.8 
 
 		 1111 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  28.57 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 1105 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 1127 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  33.18 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1107 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 868 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1107 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 782 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  28.15 
 
 		 1067 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  33.33 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 840 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  28.15 
 
 		 1067 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  29.06 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  28.15 
 
 		 1067 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>