More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2548 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 
213 aa  443  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  69.23 
 
 
211 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  72 
 
 
208 aa  314  8e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  70.39 
 
 
218 aa  305  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  66.67 
 
 
208 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  68.12 
 
 
209 aa  300  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  65.7 
 
 
208 aa  295  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  65.22 
 
 
207 aa  294  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  65.07 
 
 
207 aa  289  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  63.77 
 
 
208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  65.22 
 
 
208 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  59.8 
 
 
210 aa  260  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  50.72 
 
 
208 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
196 aa  108  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  39.16 
 
 
1287 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  35.54 
 
 
202 aa  85.1  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  34.87 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  35.37 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  31.09 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
364 aa  75.1  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.65 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  35.1 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  36.52 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  36.52 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  30.3 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  30.6 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  35.83 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  30.66 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  33.99 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  32.31 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  33.99 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  34.09 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  25.86 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
197 aa  62  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  31.06 
 
 
377 aa  61.6  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  27.53 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  25.43 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  26.02 
 
 
217 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
585 aa  58.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
217 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  34.07 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  26.01 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  24.86 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.81 
 
 
390 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
291 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  27.33 
 
 
488 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  26.01 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  28.71 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.68 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  27.85 
 
 
224 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  30.18 
 
 
323 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.65 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 
277 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  25.9 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  28.36 
 
 
343 aa  52.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
253 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
265 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  28.22 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
305 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
282 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 
226 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 
268 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
240 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 
212 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  27.18 
 
 
365 aa  52  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
208 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
291 aa  51.6  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  28.48 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  23.72 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  29.9 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  34.09 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
440 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.09 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  24.85 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  30.22 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.12 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
244 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.09 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 
353 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>