141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0156 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  53.91 
 
 
157 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  43.08 
 
 
153 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  39.68 
 
 
216 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  40 
 
 
175 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  40.8 
 
 
153 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  42.75 
 
 
205 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  38.1 
 
 
153 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  41.98 
 
 
191 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  39.55 
 
 
175 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  38.96 
 
 
156 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  36.13 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  40.94 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  35.85 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  36.11 
 
 
153 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  32.26 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  40.58 
 
 
150 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  34.92 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  37.8 
 
 
164 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  38.97 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  35.16 
 
 
153 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  31.18 
 
 
175 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  31.85 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.59 
 
 
175 aa  89  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  31.18 
 
 
175 aa  89  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  37.01 
 
 
169 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  36.5 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  34.92 
 
 
184 aa  85.5  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  33.12 
 
 
167 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  34.72 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.26 
 
 
161 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.97 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  38.17 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  34.07 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  32.67 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  32.85 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  33.81 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  33.08 
 
 
138 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  32.86 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  34.56 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  32.33 
 
 
171 aa  79  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  30.2 
 
 
169 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 
171 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  35.56 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  34.31 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.76 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  28.14 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  29.5 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.06 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.07 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.69 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.11 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  28.18 
 
 
187 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  30.08 
 
 
161 aa  62.4  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  27.4 
 
 
169 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  31.69 
 
 
155 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  25 
 
 
171 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  29.5 
 
 
185 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  29.55 
 
 
134 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.86 
 
 
157 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  25.4 
 
 
199 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  31.79 
 
 
158 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  28.87 
 
 
158 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  33.83 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  29.58 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  27.45 
 
 
163 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  32.5 
 
 
178 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  27.46 
 
 
183 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  31.11 
 
 
258 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  27.07 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  26.67 
 
 
171 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.11 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  30 
 
 
194 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  26.67 
 
 
171 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.3 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  32.58 
 
 
192 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  25.35 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  26.21 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  26.21 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  32.84 
 
 
175 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  26.21 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  26.25 
 
 
183 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  26.06 
 
 
183 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  30.63 
 
 
185 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 
333 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  31.89 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  31.01 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  26.45 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  25 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  29.52 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  30.36 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  26.03 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  30.4 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  29.93 
 
 
284 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  33.33 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  36.96 
 
 
382 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  31.68 
 
 
350 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  29.37 
 
 
192 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  33.58 
 
 
214 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>