60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3753 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  100 
 
 		 285 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  58.05 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  53.5 
 
 		 343 aa  208  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  51.59 
 
 		 262 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  51.59 
 
 		 262 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  51.59 
 
 		 262 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  51 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  49.6 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  43.37 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  41.53 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  41.6 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  47.26 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  43.85 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  48.93 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  41.77 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  43.19 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  41.38 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  42.76 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  44.31 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  38.55 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  40.76 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  41.13 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  42.11 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  36.59 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  28.63 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  36.91 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  30.81 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  32.05 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  28.96 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  34.48 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  27.97 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  26.84 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  33.58 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  27.62 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  33.57 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  26.4 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  30.52 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  28.71 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  24.69 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  28.99 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  32.72 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  28.05 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  30.77 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  26.87 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  35.71 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  26.67 
 
 		 590 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  29.44 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  31.21 
 
 		 170 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  27.86 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  25.68 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  30.87 
 
 		 187 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  27.21 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  31.36 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  34.69 
 
 		 200 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  34.12 
 
 		 406 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  30.56 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  33.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  29.31 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  32.84 
 
 		 185 aa  42.4  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>