More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0573 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  100 
 
 
388 aa  769    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  60.16 
 
 
388 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.72 
 
 
438 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  45.31 
 
 
452 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  41.53 
 
 
393 aa  249  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  48.89 
 
 
204 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  43.15 
 
 
340 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  45.6 
 
 
374 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  42.28 
 
 
475 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  42.28 
 
 
475 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  42.28 
 
 
475 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  45.64 
 
 
248 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  49.14 
 
 
417 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  44.97 
 
 
256 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  44.97 
 
 
256 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  45.9 
 
 
469 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  45.9 
 
 
469 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  45.9 
 
 
469 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  38.3 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  53.15 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  38.3 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  38.3 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  38.3 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  47.58 
 
 
225 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  42.96 
 
 
256 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  42.96 
 
 
256 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  44.26 
 
 
467 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  38.55 
 
 
248 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  44.26 
 
 
472 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  43.62 
 
 
256 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
228 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  43.44 
 
 
467 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  42.42 
 
 
241 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
221 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  53.4 
 
 
333 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  43.44 
 
 
467 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
241 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
478 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.54 
 
 
321 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  48.65 
 
 
394 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  43.09 
 
 
472 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  50.96 
 
 
370 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  40 
 
 
230 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  42.86 
 
 
1048 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  42.95 
 
 
164 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
479 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
432 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  45.04 
 
 
253 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  48.39 
 
 
265 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  50.91 
 
 
317 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  49.15 
 
 
308 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  42.54 
 
 
427 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35.8 
 
 
274 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.04 
 
 
329 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  45.71 
 
 
342 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  38.35 
 
 
505 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.86 
 
 
475 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
295 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.22 
 
 
308 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  47.01 
 
 
340 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  43.97 
 
 
459 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  47.22 
 
 
378 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  38.71 
 
 
364 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  46.88 
 
 
257 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.31 
 
 
332 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
239 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.25 
 
 
531 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  46.3 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
502 aa  99.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  33.12 
 
 
232 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  45.3 
 
 
349 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  44.76 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.67 
 
 
162 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  44.95 
 
 
291 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  49.06 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  35.58 
 
 
210 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
180 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  38.32 
 
 
362 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  38.32 
 
 
362 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.27 
 
 
331 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  48.54 
 
 
535 aa  96.7  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  37.72 
 
 
362 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  41.22 
 
 
306 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  42.06 
 
 
370 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
463 aa  96.3  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
337 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  44.54 
 
 
302 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  42.73 
 
 
487 aa  96.3  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  43.56 
 
 
491 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.19 
 
 
235 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  45.22 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  43.48 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  44.86 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  44.86 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
293 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  37.69 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>