More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2055 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  96.44 
 
 		 393 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  91.6 
 
 		 393 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  91.35 
 
 		 393 aa  705    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  91.35 
 
 		 393 aa  705    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 393 aa  805    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  36.51 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  37.23 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  33.25 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  37.37 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  35.31 
 
 		 423 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  33.5 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  37.26 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  35.81 
 
 		 423 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  33 
 
 		 434 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  34.96 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  32.98 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  36.09 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  35.12 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  34.95 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  34.79 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  36 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  35.09 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  35.92 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  31.28 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  32.28 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  32.63 
 
 		 431 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  33.69 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  31.47 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  32.03 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  32.03 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.62 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  31.78 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  35.57 
 
 		 406 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  35.57 
 
 		 406 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  34.63 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  30.4 
 
 		 466 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  33.68 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  33.76 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  32.35 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  31.56 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  33.15 
 
 		 409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  31.75 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  32.18 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  26.32 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  32.93 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  29.61 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  30.84 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  31.13 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  31.31 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  30.26 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  31.66 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  29.06 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.13 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.2 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  28.43 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  33.75 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  29.2 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 413 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  32.27 
 
 		 383 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  31.53 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.71 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  25.35 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  33.63 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  31.02 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.37 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.77 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  33.02 
 
 		 358 aa  87  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  25.63 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.02 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  28.77 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  23.99 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  30.09 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>