253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0714 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 386 aa  766    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  39.69 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  37.56 
 
 		 416 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  38.87 
 
 		 382 aa  236  7e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  39.13 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  34.12 
 
 		 375 aa  212  9e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  37.7 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  30.08 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  30.67 
 
 		 386 aa  196  9e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  30.23 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 385 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  31.96 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  32.96 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  34.4 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  32.49 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  32.77 
 
 		 390 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  31.83 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  36.26 
 
 		 385 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  31.13 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  29.27 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  35.01 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 		 406 aa  162  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  29.87 
 
 		 396 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.07 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  28.57 
 
 		 379 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 391 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  31.22 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  26.38 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  29.44 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  30.73 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  29.1 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  29.67 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  32.88 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  31.19 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.7 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  26.42 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 361 aa  97.1  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  28.37 
 
 		 363 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  30.94 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  28.91 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  24.51 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 413 aa  79.3  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  27.99 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  29.86 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  26.27 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  23.46 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  23.28 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.76 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  21.61 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  22.71 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  25.55 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.29 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  23.95 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  26.71 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  21.19 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.06 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.66 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.06 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  23.72 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>