118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0513 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 385 aa  772    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  38.54 
 
 		 385 aa  279  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  40.93 
 
 		 385 aa  276  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.62 
 
 		 390 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.26 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  27.09 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  32.14 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 395 aa  99.4  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 		 391 aa  89.7  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.51 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  28.3 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  24.39 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.28 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  31.12 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  24.59 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  23.54 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  21.51 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  21.74 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  23.71 
 
 		 431 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  25.93 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  28.15 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  24.51 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  25.27 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.37 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  24.51 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  24.23 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  24.24 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  22.88 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  23.94 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  24.23 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 		 380 aa  53.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  24.79 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  24.79 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  24.79 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  24.79 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  24.79 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  24.03 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  23.67 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.56 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  24.51 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  32.91 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  21.07 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  24.82 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  23.38 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.51 
 
 		 468 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  21.73 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  24.51 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  18.9 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  28.2 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.89 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.66 
 
 		 446 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.14 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.1 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.82 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  20.8 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.66 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  29.86 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  22.08 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  24.74 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.98 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  21.01 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1058  HI0933 family protein  20.1 
 
 		 425 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  25.7 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.83 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>