More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1049 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 389 aa  775    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  77.42 
 
 		 375 aa  580  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0003  putative transcriptional regulator, GntR family  41.13 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 383 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3001  GntR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  37.96 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1763  aminotransferase, class I and II  38.98 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59119  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 611 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 437 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.69 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 438 aa  209  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 		 463 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.73 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  34.22 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 416 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.31 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  37.5 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 377 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 		 446 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  36 
 
 		 440 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  35.66 
 
 		 441 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 401 aa  200  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  35.75 
 
 		 395 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  36.04 
 
 		 493 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 395 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  34.58 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  34.77 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  31.89 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 400 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 398 aa  195  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4078  aminotransferase class I and II  36.19 
 
 		 412 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.48 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  36.19 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 394 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 481 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 480 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  33.6 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  30.62 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.16 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  34.14 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 396 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  36 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  28.15 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  35.6 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  29.3 
 
 		 405 aa  182  8.000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 393 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  36.66 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  35.58 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  30.51 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  37.03 
 
 		 498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  29.56 
 
 		 390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  35.41 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  35.41 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 481 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>